【发布时间】：2021-01-10 02:25:55
【问题描述】：
我正在对来自 Smiles 文件的一些分子进行聚类。我阅读它们，将它们转换为 mols，然后将它们转换为 Morgan Fingerprints，我用它来计算相似度，然后进行聚类。
但是我想将聚类结果输出到文件中。理想情况下，这是以微笑格式完成的，以便可以再次读取以进行评估。
请问这个怎么做？
【问题讨论】：
【发布时间】：2021-01-10 02:25:55
【问题描述】：
我找到的唯一方法是获取列表 Smiles，将它们转换为 Mols，然后转换为 Fingerprints。因此指纹和分子的列表具有相同的大小和顺序
指纹[0] == 摩尔[0]
就它们所代表的分子而言。聚类指纹返回列表中指纹的索引，因此索引可用于从 Mol 列表中检索分子。
我不认为这是最干净的解决方案，但确实有效。
【讨论】：