在 R 脚本 (rpy2) 中使用来自 python 的数据在 python 中运行 R 脚本答案

【问题标题】：Run R script in python using data from python in the R script (rpy2)在 R 脚本 (rpy2) 中使用来自 python 的数据在 python 中运行 R 脚本
【发布时间】：2018-12-04 18:42:56
【问题描述】：

我想用 rpy2 在 python 中运行一个 R 脚本，我已经知道该怎么做

R代码是：

dataR = data.frame( Ingresos = c(23,45,24,23,54),
                    Bonos = c(23,45,12,67,54),
                    Deuda = c(23,4,1,6,3),
                    row.names = c("Nathy", "Tomas", "Joe", "Emily", "Javi") )
dataR
promedio_ingresos = mean(dataR$Ingresos)
Max_Ing = sort(dataR$Ingresos[dataR$Ingresos>promedio_ingresos])
Max_Ing

要在 python 中运行这个 R 脚本，我使用：

import rpy2
from rpy2.robjects.packages import importr
import rpy2.robjects as robjects
r = robjects.r
output = r.source("R_script_run_in_python.R")
output

输出从我的 R 代码中获取最后一个值

现在我想运行相同的代码，但使用我在 python 中定义的数据，例如：

import pandas as pd
df = pd.DataFrame( np.random.randn(5,3), 
                   columns = ["Ingresos","Bonos","Deuda"], 
                   index = ["Max", "Nathy", "Tom", "Joe", "Kathy"] )

所以我现在要运行的 R 代码就是：

promedio_ingresos = mean(dataR$Ingresos)
Max_Ing = sort(dataR$Ingresos[dataR$Ingresos>promedio_ingresos])
Max_Ing

但是dataR是df，我该怎么做呢？

【问题讨论】：

很好奇为什么需要在 R 中运行什么可以在 pandas 中轻松运行？通常rpy2 用于一个专用模块/库，而不是另一个。
@Parfait 我在 R 和 python 中有一些代码，现在我们正在将所有代码迁移到 python，但是我想利用 R 开发的非常好的库和代码，例如记分卡库来自 R。我也不会花太多时间将一些代码从 R 迁移到 python

标签： python r rpy2

【解决方案1】：

我试过了，效果很好

# Data    
# Pandas dataframe
df = pd.DataFrame( np.random.randn(5,3),
                   columns = ["Ingresos","Bonos","Deuda"],
                   index = ["Max", "Nathy", "Tom", "Joe", "Kathy"] )   
# rpy2 datframe
dataR = pandas2ri.py2ri(df)

# R code
robjects.globalenv["dataR"] = dataR
robjects.r('''
           promedio_ingresos = mean(dataR$Ingresos)
           Max_Ing = sort(dataR$Ingresos[dataR$Ingresos>promedio_ingresos])
''')
print(robjects.globalenv["dataR"])
print(robjects.globalenv["promedio_ingresos"])
print(robjects.globalenv["Max_Ing"])

【讨论】：