使用 SubProcess 在 Python 中运行 R 脚本时出错答案

【问题标题】：Error while running R script in Python with SubProcess使用 SubProcess 在 Python 中运行 R 脚本时出错
【发布时间】：2018-05-18 02:06:10
【问题描述】：

在执行 python 脚本时，我正在尝试运行与 python 脚本位于同一目录中的 R 脚本。

到目前为止，我有：

if condition is True:
    import subprocess
    subprocess.call (["C:/Program Files/R/R-3.4.3/Rscript", "./testing.r"])
    sys.exit()

我不断收到错误：

OSError: [WinError 193] %1 is not a valid Win32 application

我尝试将“C:/Program Files/R/R-3.4.3/Rscript”替换为“/usr/bin/Rscript”，但仍然出现同样的错误。我想知道是否有人会知道为什么它一直抛出这个错误？

【问题讨论】：

确定不应该用cmd提交吗？
试试这个subprocess.call(['C:/Program Files/R/R-3.4.3/Rscript', '--vanilla', 'testing.r'], shell = True) 或提供 R 脚本文件的完整路径
我猜这可能是路径问题。（R 版本和 Rscript 路径肯定是正确的？）如果是，那么给出 testing.r 的完整绝对路径，所以 'C:/full/absolute/path/to/testing.r' （或者它在 ' D:/'偶数）？
我已经尝试了这两个建议，但得到一个错误，“C:/Program Files/R/R-3.4.3/Rscript”不被识别为外部或内部命令。

标签： python r subprocess

【解决方案1】：

我相信 subprocess.call 的参数会直接传递到命令行，因此您需要将引号转义为 "\"C:/Program Files/R/R-3.4.3/Rscript\"" .话虽如此，当我使用它时，我得到一个 [WinError 5] 访问冲突错误。一种解决方法是使用 executable 参数：

import sys
import subprocess

if True is True:
    subprocess.call(["C:/Program Files/R/R-3.4.3/Rscript.exe", "./testing.r"], 
                    executable="C:/Program Files/R/R-3.4.3/Rscript.exe")
    sys.exit()

另外，请确保 C:/Program Files/R/R-3.4.3/Rscript.exe 是您的 Rscript.exe 的位置。我的是 C:/Program Files/R/R-3.4.3/bin/Rscript.exe。

【讨论】：

是的，我错过了“C:/Program Files/R/R-3.4.3/bin/Rscript.exe”中的“bin”。谢谢！