在 Jupyter 中安装 R 包答案

【问题标题】：Install R package in Jupyter在 Jupyter 中安装 R 包
【发布时间】：2017-11-12 15:19:13
【问题描述】：

周末我一直在尝试在运行 Ubuntu 16.04 的 Jupyter Notebook 的 R 内核 (3.4.2) 上安装 mosaic、car 和其他一些软件包。我试过install.packages('car', '/home/jayaramdas/anaconda3/lib/R/library/', repos='http://cran.us.r-project.org')：它返回：还安装依赖项'pbkrtest'

Warning message in install.packages("car", "/home/jayaramdas/anaconda3/lib/R/library/", : “installation of package ‘pbkrtest’ had non-zero exit status”Warning message in install.packages("car", "/home/jayaramdas/anaconda3/lib/R/library/", : “installation of package ‘car’ had non-zero exit status”

我尝试将它安装在原始 R 包中，我得到了这个： Warning messages: 1: In install.packages("car", "/home/jayaramdas/anaconda3/lib/R/library/", : installation of package ‘pbkrtest’ had non-zero exit status 2: In install.packages("car", "/home/jayaramdas/anaconda3/lib/R/library/", : installation of package ‘car’ had non-zero exit status

我尝试使用 Rstudio 安装它，但它不会让我写文件。我还尝试下载 Ubuntu 的 zip 文件，但它仍然给出了“非零退出error. Is this a usual problem that people have withcar”和其他 R 包？我只是想弄清楚如何将一些包添加到我的 jupyter 笔记本中。

【问题讨论】：

我们能看到完整的错误日志吗？
@Daruchini：我刚刚更新了帖子以反映我收到的一些反馈。
检查以确保您已安装 pbkrtest 或尝试使用 dependancies = T 安装软件包

标签： r ubuntu jupyter-notebook

【解决方案1】：

你在 Ubuntu 上。您想使用包管理器 (conda)。

我可以建议你使用 native 吗？

sudo apt-get install r-cran-car

将安装car 及其所有依赖项。如果没有，请提交 Ubuntu 错误报告。

同样，您可以从 Ubuntu 获得许多更多软件包：apt-cache search 'r-cran-*'。一旦你考虑了 Rutter PPA，你就有了 CRAN 的大部分预构建。

【讨论】：

我应该从cd ~/anaconda 运行上述内容吗？
没关系——它将安装car 包作为标准Ubuntu系统的一部分。值得一提的是，我还运行 Jupyter 而无需求助于conda。 YMMV。但是你有选择。祝你好运，
我能够让安装工作。但是，现在当我启动一个 jupyter 浏览器并运行 install.packages("car"): 我得到一个 installing Warning message in install.packages("car"): “installation of package ‘minqa’ had non-zero exit status”Warning : message in install.packages("car"): “installation of package ‘car’ had non-zero exit status” error. 如果我运行 library(car) 然后我得到这个错误：Error in library("car"): there is no package called ‘car’ Traceback: 1. library("car") 2. stop(txt, domain = NA)