【问题标题】:Multivariate (polynomial) best fit curve in python?python中的多元(多项式)最佳拟合曲线?
【发布时间】:2012-08-05 01:44:18
【问题描述】:

如何在 python 中计算最佳拟合线,然后将其绘制在 matplotlib 中的散点图上?

我使用普通最小二乘回归计算线性最佳拟合线如下:

from sklearn import linear_model
clf = linear_model.LinearRegression()
x = [[t.x1,t.x2,t.x3,t.x4,t.x5] for t in self.trainingTexts]
y = [t.human_rating for t in self.trainingTexts]
clf.fit(x,y)
regress_coefs = clf.coef_
regress_intercept = clf.intercept_      

这是多变量的(每种情况有许多 x 值)。因此,X 是列表列表,y 是单个列表。 例如:

x = [[1,2,3,4,5], [2,2,4,4,5], [2,2,4,4,1]] 
y = [1,2,3,4,5]

但是如何使用高阶多项式函数来做到这一点。例如,不仅是线性的(x 的 M=1 次方),还有二项式(x 的 M=2 次方)、二次方(x 的 M=4 次方)等等。例如,如何从以下获得最佳拟合曲线?

摘自 Christopher Bishops 的“模式识别和机器学习”,第 7 页:

【问题讨论】:

标签: python matplotlib machine-learning regression scatter-plot


【解决方案1】:

this question 接受的答案 提供 a small multi poly fit library 它将完全满足您使用 numpy 的需要,并且您可以将结果插入到绘图中,如下所述。

您只需将 x 和 y 点数组以及所需的拟合度(顺序)传入multipolyfit。这将返回您可以使用 numpy 的 polyval 进行绘图的系数。

注意:以下代码已被修改为进行多元拟合,但绘图图像是早期非多元答案的一部分。

import numpy
import matplotlib.pyplot as plt
import multipolyfit as mpf

data = [[1,1],[4,3],[8,3],[11,4],[10,7],[15,11],[16,12]]
x, y = zip(*data)
plt.plot(x, y, 'kx')

stacked_x = numpy.array([x,x+1,x-1])
coeffs = mpf(stacked_x, y, deg) 
x2 = numpy.arange(min(x)-1, max(x)+1, .01) #use more points for a smoother plot
y2 = numpy.polyval(coeffs, x2) #Evaluates the polynomial for each x2 value
plt.plot(x2, y2, label="deg=3")


注意:这是前面答案的一部分,如果您没有多变量数据,它仍然是相关的。代替coeffs = mpf(...,使用coeffs = numpy.polyfit(x,y,3)

对于非多变量数据集,最简单的方法可能是使用 numpy 的polyfit

numpy.polyfit(x, y, deg, rcond=None, full=False, w=None, cov=False)

最小二乘多项式拟合。

将次数为deg 的多项式p(x) = p[0] * x**deg + ... + p[deg] 拟合到点(x, y)。返回最小化平方误差的系数 p 向量。

【讨论】:

  • 这如何应用于多元回归?由于我有多个 x 变量(每种情况下 5 个),我有一个用于 x 的二维数组(列表列表)。我的 x 看起来像这样:[[1,2,3,4,5],[2,3,4,5,6],..]。将其输入到您的答案中,我得到TypeError: expected 1D vector for x
  • 这些单独的数据集是分开分析还是合并分析? y 值是什么样的?
  • @jozzas 模块multipolyfit 来自哪里?尝试导入它会导致导入错误:ImportError: No module named multipolyfit.multipolyfit ...
  • 我刚刚注意到这个问题。我已经更新了 repo 的组织,添加了一个宽松的开源许可证,并将其发布在 PyPi 上。你应该能够 easy_install multipolyfit 。
  • 我得到一个 TypeError: can only concatenate tuple (not "int") to tuple error for line Stacked_x = numpy.array([x,x+1,x-1])。跨度>
【解决方案2】:

由于结果函数不是多项式,所以有点脱离上下文,但也许仍然很有趣。多项式拟合的一个主要问题是Runge's phenomenon:度数越高,发生的振荡就越剧烈。这也不仅仅是构造出来的,它还会回来咬你。

作为补救措施,我不久前创建了smoothfit。它解决了一个适当的最小二乘问题并给出了很好的结果,例如:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import smoothfit

x = [1, 4, 8, 11, 10, 15, 16]
y = [1, 3, 3, 4, 7, 11, 12]
a = 0.0
b = 17.0
plt.plot(x, y, 'kx')

lmbda = 3.0  # controls the smoothness
n = 100
u =  smoothfit.fit1d(x, y, a, b, n, lmbda)

x = np.linspace(a, b, n)
vals = [u(xx) for xx in x]
plt.plot(x, vals, "-")
plt.show()

【讨论】:

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