R_HOME rpy2 错误答案

【问题标题】：R_HOME Error with rpy2R_HOME rpy2 错误
【发布时间】：2013-07-08 13:55:47
【问题描述】：

我知道有很多关于在 Windows 7 32 位上启动和运行 rpy2 的帖子。我参考了其中的很多并尝试了他们的解决方案，包括使用PypeR。

我没有在我的路径中明确设置 R_HOME 变量，但根据 question，我确认 R 在我的 PATH 中（我可以在命令行中键入 R 并让 R 运行）甚至复制从 i386 文件夹到父 bin 文件夹的所有文件。

我的问题贴在下面。有什么想法吗？

In [5]: from rpy2 import robjects
---------------------------------------------------------------------------
RuntimeError                              Traceback (most recent call last)
<ipython-input-5-1f019d00d232> in <module>()
----> 1 from rpy2 import robjects

C:\Anaconda\lib\site-packages\rpy2\robjects\__init__.py in <module>()
     16 import rpy2.rlike.container as rlc
     17
---> 18 from rpy2.robjects.robject import RObjectMixin, RObject
     19 from rpy2.robjects.vectors import *
     20 from rpy2.robjects.functions import Function, SignatureTranslatedFunction

C:\Anaconda\lib\site-packages\rpy2\robjects\robject.py in <module>()
      3 import rpy2.rinterface
      4
----> 5 rpy2.rinterface.initr()
      6
      7 import conversion

RuntimeError: R_HOME not defined.

【问题讨论】：

标签： python r windows-7 rpy2

【解决方案1】：

我确认此问题与未定义的 R_HOME 变量有关。

在我看来，所有这些问题都是因为rpy2 软件包的开发人员没有正确记录他们的软件要求：

安装R
创建R_HOME系统变量
将R_HOME\bin 添加到PATH，以便从python 执行R
将R_HOME\bin\x64 添加到PATH，以便加载R.dll
安装包tzlocal

【讨论】：

-2 你用什么命令来安装r？我将它安装在 python 2.7 还是 3 上是否重要？我正在尝试在 jupiter notebook 上完成安装。具体来说，Google Cloud Datalab 谢谢，Eila
我必须做的一个额外步骤是在 PATH 中获取一个 POSIX sh（如 MSYS2 或 git4windows）
如果你已经安装了R，先用which R找到R的路径。它给出了类似/your_R_path/bin/R 的路径。然后我用 bin 目录的路径指定R_HOME：R_HOME=/your_R_path/bin/。然后回到python并安装。它对我有用。
答案中没有给出命令。为什么会这样？

【解决方案2】：

在上述评论的帮助下，我朝着正确的方向前进。我将 R_HOME 创建为 SYSTEM 变量。这并没有立即奏效，因为我收到了 R_USER 未定义错误。

为了使上述导入的所有内容都能正常工作，我只是在定义 R_HOME 后从here 重新安装了 rpy2 可执行文件。没有错误。

总之，关键是在安装 rpy2 之前设置了 R_HOME。

【讨论】：

这看起来很奇怪。我记得在 Windows 中设置环境变量需要注销/登录（用户级变量）和重新启动（系统级变量）。可能是这个问题吗？