从多个图像中提取多个 ROI 像素值答案

【问题标题】：Extract multiple ROI pixel value from multiple images从多个图像中提取多个 ROI 像素值
【发布时间】：2013-11-19 02:23:31
【问题描述】：

我遇到的编程挑战超出了我结结巴巴的 Matlab 专业知识的能力范围。我有一个单元格数组中的图像列表和 ROI 掩码列表，我想分别提取每个 ROI 的平均像素值，我的代码是这样的：

files=dir('*.tif');
for f=1:length(files)
image=im2double(imread(files(f).name));       
pixel_value(:,f)=cellfun(@(x) extractROIpixel(x,image), mask);    
% apply extractROIpixel on each cell of the mask array
end

function [ mean_pixel_value ] = extractROIpixel( mask, img )
      mask=im2double(mask);
      mask(mask == 0) = NaN;
      mask_area=mask.*img;
      mean_pixel_value=mean(mask_area(~isnan(mask_area)));  
end

这可行，但速度很慢（

【问题讨论】：

标签： matlab mask roi

【解决方案1】：

怎么样：

files=dir('*.tif');
for f=1:length(files)
   image=im2double(imread(files(f).name));
   masked=cellfun(@(x) image.*x, mask);
   stats{f}=cellfun(@(x) regionprops(x, 'MeanIntensity'), masked);
end

我没有对这两种方法进行基准测试，所以我不知道它是否更有效。

【讨论】：

感谢您的快速回答，但它无法正常工作，因为我想在同一图像中对我的掩码数组的每个单元格应用“掩码”函数：换句话说，我必须在整个掩码数组中应用函数，保持图像不变并迭代我的所有图像。因此我在图像列表上的“for”循环。
我明白了。我相应地对其进行了编辑。同样，我不知道regionprops 是否有效。
感谢您指出我不知道的 regionprops 方法...但它实际上比我的 extractROIpixel 函数花费的时间要多一倍。
好的，很高兴知道。这很方便，但显然不是很精简。