Sweave 和 Lyx fig=T 在 Sweave

Question

我正在关注 Gregor Gorjanc 的 tutorial on LyX & Sweave。使用安装了所有 texlive-full 的 Ubuntu 10.04 和 LyX 版本 1.6.5。

R 导致数字输出的废品生成有效的 PDF。

但是，当我尝试编译像这样的简单数字时

<<chunk, fig=T>>=       [ctrl+enter]
hist(rnorm(100))        [ctrl+enter]
@

我得到了神秘的错误。要么没有找到 chunk.temp.Rnw，要么 LaTeX 遇到错误，我应该点击 <enter> 忽略。

如果我将fig 更改为figure 并将T 更改为TRUE，则LyX 文档将编译但不显示任何图形。使用pgfsweave，我得到this error，或者有时是this one。

我是否使用了错误版本的这些程序？有没有办法引出更好的错误信息？我可以以某种方式潜入 LaTeX 提示并自己点击 <enter> 吗？

更新：我was使用了错误的LaTeX版本； Ubuntu 的默认设置太旧了。我还需要更新到LyX 2.0.1 和更新版本的pgf 和pgfSweave（程序是不同的）。

新的（无法描述的）错误消息是：An error occurred while running: Rscript '/home/mars/.lyx/scripts/lyx-sweave-exec.R' 'UTF-8' 'pgfSweave' "/home/mars/" "/tmp/lyx_tmpdir.T1663/lyx_tmpbuf2/" "test.sweave.lyx.Rnw" > "test.sweave.Rnw".log 2>&1

Answer 1

根据https://tex.stackexchange.com/questions/27993/can-i-download-ctan-packages-from-the-command-line-ubuntu/27994#27994 的说法，Ubuntu 中的TeX 存在一个长期存在的问题：他们的软件包远远落后。由于Sweave 的许多创新发生在 2010-2011 年，因此似乎必须从http://ftp.ctex.org/mirrors/CTAN/systems/texlive/Images/ 下载并安装.iso，而不是使用Synaptic。包管理就这么多！

只有当这确实有效时，我才会接受我自己的答案。

更新：确保您使用disregard anything you read about Noweb.sty，因为在LyX 2.0.1 中有一个“Sweave 模块”，这意味着您应该只使用常规文档类（article、book、report ) -- scraps 被 chunks 替换，本质上 Sweave 是本地处理的。还有disregard Brett Collier's lucid explanation 如何安装LyX 因为它现在已经过时了，尽管Gregor Gorjanc 的高度可谷歌blog post 说它有效。这也是过时的，或者它只适用于 Ubuntu 9 而不是 Ubuntu 10.04。

因此，截至 2011 年 8 月，成功让 Sweave 在 LyX 中为 Ubuntu 10.04 工作的步骤是：

1. 从 tug.org 获取最新的texlive，而不是从 Synaptic 获取的。怎么做：https://tex.stackexchange.com/questions/27993/can-i-download-ctan-packages-from-the-command-line-ubuntu/27994
2. 获取pgf 和kTikz，如下所述：http://justbloodywork.blogspot.com/2011/07/installing-latex-and-pgf.html
3. 在此处按照 Yihue 的说明进行操作：http://yihui.name/en/2010/10/how-to-start-using-pgfsweave-in-lyx-in-one-minute/#comment-10929。从源代码构建lyx-devel，应用 Yihue 的补丁，并配置一些 LyX 首选项。
4. Tools > ReconfigureLyX.
5. 祈祷。
6. 启动LyX并从（3）加载Yihue的测试文件。点击Ctrl + R，而不是Ctrl + D查看。