有没有更有效的方法来计算距离矩阵？

Question

我有一百个 288 数组，我需要为所有数组计算一个距离矩阵，它与下面的代码一起工作。 10 秒。有没有更有效的方法来做到这一点，因为它需要用 50000 个数组来完成，而且需要太多时间。

dist=np.zeros((100,100))
pf = np.array(purpose_fin)
  for i in range(100):
   for j in range(100):
    dist[i][j] = 288-sum(np.equal(pf[i],pf[j]))

Answer 1

使用 Scipy 库

from scipy.spatial import distance_matrix
distance_matrix([[0,0],[0,1]], [[1,0],[1,1]])

scipy.spatial.distance_matrix

汉明距离

from scipy.spatial import distance
distance.hamming([1, 0, 0], [0, 1, 0])

Hamming Distance