【发布时间】:2020-04-01 13:27:28
【问题描述】:
我需要使用列名(400, 400.5, 401....) 作为 x 轴,数据框值作为 y 轴,并使用索引列 ('fluorophore') 作为该线图的标签来制作线图。我希望能够选择要绘制的fluorophores。
我怎样才能做到这一点?
【问题讨论】:
标签: python pandas matplotlib plot
我需要使用列名(400, 400.5, 401....) 作为 x 轴,数据框值作为 y 轴,并使用索引列 ('fluorophore') 作为该线图的标签来制作线图。我希望能够选择要绘制的fluorophores。
【问题讨论】:
标签: python pandas matplotlib plot
我不知道你的数据集,所以如果它总是只是完整的 NaN 列,你可以这样做
df[non_nan_cols].T[['FAM', 'TET']].plot.line()
non_nan_cols 是不包含 NaN 值的列的列表。
你也可以
choice_of_fp = df.index.tolist()
x_val = np.asarray(df.columns.tolist())
for i in choice_of_fp:
mask = np.isfinite(df.loc[i].values)
plt.plot(x_val[mask], df.loc[i].values[mask], label=i)
plt.legend()
plt.show()
允许具有 NaN 值。这里choice_of_fp 是一个包含您要绘制的荧光团的列表。
【讨论】:
您可以执行以下操作,它将使用除索引之外的所有列并绘制图表。
abs_data.set_index('fluorophore ').plot()
如果你想过滤荧光团的值,那么你可以这样做
abs_data[abs_data.fluorophore .isin(['A', 'B'])].set_index('fluorophore ').plot()
【讨论】: