R：使用ggplot在单个图上绘制两个散点图答案

【问题标题】：R: two scatterplots on single graph using ggplotR：使用ggplot在单个图上绘制两个散点图
【发布时间】：2011-08-25 14:49:50
【问题描述】：

请注意我是 R 的初学者。我使用 merge() 方法将两个数据框与一个公共列合并。我已经获得了如下数据框：

 x   y1   y2
 1   3    5
 2   2    4
 1   2    2
 3   5    5
 ...

等等。我想用ggplot绘制这样的数据框。我创建的（使用geom_point 的文档是

ggplot(data = dat_c, aes(games, variance.x)) + 
     geom_point(aes(x = games, y = variance.x), legend=  TRUE,  xlab="X", ylab="Y", colour=alpha('red', 0.05)) + 
     geom_point(aes(x = games, y = variance.y), legend = TRUE, colour=alpha('blue', 0.05) )

它有效，NaN 不会打扰我，因为我收到警告说它们被忽略了，这很好。但是我有两个问题，我不知道如何解决它们：

我的实际绘图位于左下角，我想设置 X 和 Y 轴的最大值（以动态方式，例如数据中的最大值 + 100 或类似的东西）
图例不显示
未描述轴

下面是它的样子：

【问题讨论】：

标签： r ggplot2

【解决方案1】：

另见：

（这些是搜索[r] ggplot melt 的结果，尽管您也可能通过[r] ggplot legend 到达那里...）

如果可以，请获取ggplot 书的副本并从头开始阅读 - 不幸的是，该草稿的 PDF 不再在线提供，但该书值得投资。

实际上，您的某些点的 x 和 y 值接近绘图的极值。很难看到它们，因为它们几乎是透明的（在白色背景上看到它们会更容易一些，即尝试将 +theme_bw() 添加到您的 ggplot 调用中）。如果要限制绘图的范围，可以使用 xlim 和 ylim。（在您的数据上尝试summary 并查看最大值...）
绘制坐标轴的最佳方法是遵循ggplot 的习语，将数据“融合”成一个长格式数据集，其中一列用于该类别（y1 与 y2）另一个是值，如下：

  d <- data.frame(x=c(1,2,1,3),
                y1=c(3,2,2,5),
                y2=c(5,4,2,5))
  library(ggplot2) 
  library(reshape2) ## for melt()
  dm  <- melt(d,id.var=1)
  ggplot(data=dm,aes(x,value,colour=variable))+
  geom_point(alpha=0.2)+
  scale_colour_manual(values=c("red","blue"))+
  labs(x="games",y="variance")

（抱歉格式有点奇怪）我将alpha 的值设置得更高一点，否则很难看到图中的点。我认为默认颜色（红色和蓝色）还可以，但我使用scale_colour_manual 以按照您指定的方式获取它们。

我不确定你的意思。

【讨论】：

非常感谢您的回答。最后一点是关于 X 和 Y 轴的标签 - 你已经用 labs() 方法覆盖了它，我不知道（我试过 xlab 和 ylab）。
好的。如果你这样做 +xlab("games")+ylab("variance") 也应该有效（作为 ggplot 对象中的单独术语，而不是在 geom_point() 调用中......）
@BenBolker scale_colour_manual 有命名参数 value 吗？在我看来是values，最后是's'。

【解决方案2】：

您应该 melt 将您的数据转换为长格式，然后将颜色美学映射到融化的 data.frame 中的变量列。像这样的：

dat <- data.frame(x = c(1,2,1,3), y1 = c(3,2,2,5), y2 = c(5,4,2,5))

dat.m <- melt(dat, id.vars = "x")

ggplot(dat.m, aes(x, value, colour = variable)) +
  geom_point() +
  scale_colour_manual(values = c("red", "blue"))

您可以分别使用xlim() 和ylim() 手动设置限制。不清楚你在用 alpha 做什么，所以我将把它留给你。

【讨论】：