折叠矩阵以将一列中的值与另一列中的值相加答案

【问题标题】：Collapse a matrix to sum values in one column by values in another折叠矩阵以将一列中的值与另一列中的值相加
【发布时间】：2012-08-01 23:51:56
【问题描述】：

我有一个包含三列的矩阵：县、日期和就诊次数。每个县的日期重复，如下所示（仅作为示例）：

  County A  1/1/2012  2
  County A  1/2/2012  0
  County A  1/3/2012  5
  ... etc.
  County B  1/1/2012  3
  County B  1/2/2012  4
  ... etc.

我想折叠此矩阵以汇总每个日期所有县的访问量。所以它看起来像这样：

1/1/2012  5
1/2/2012  4
etc.

我正在尝试在 R 中使用 "table()" 函数，但似乎无法让它以这种方式按日期对访问进行操作。当我做"table(dt$date, dt$Visits)" 时，它给了我一个这样的频率表：

             0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15
  2011-01-01 3 1 2 0 1 1 0 2 0 0  0  0  0  0  0  0
  2011-01-02 2 3 1 0 0 1 0 0 1 0  2  0  0  0  0  0
  2011-01-03 3 1 1 2 1 0 0 0 0 1  0  0  0  0  1  0

有什么建议吗？有没有更好的函数可以使用，也许是某种“总和”？

谢谢！

【问题讨论】：

标签： r matrix

【解决方案1】：

table() 不是用于求和，而是用于记录计数。如果你想使用tapply，你会得到一个表格输出并且可以应用sum 函数。或者您可以使用ave 来获得与数据帧等长的总和向量。也许：

  with( EDcounts, tapply(EDcounts[[3]], EDcounts[[2]], sum, na.rm=TRUE) )

如果您将“访问”列名称放在公式的 LHS 上，您也可以将 xtabs 哄骗到访问次数的总和中。

【讨论】：

谢谢！ Taply 工作得很好。以前从未见过“with”——太酷了！
with 将大大简化您的控制台工作。它的帮助页面警告说，它可能会导致函数内部出现错误，就像使用“$”作为函数一样。

【解决方案2】：

正如@DWin 所说，table() 不是用于求和，而是用于记录计数。

我给出了三个方法示例，分别使用plyr、data.table 和aggregate

all_data <- expand.grid(country = paste('Country', LETTERS[1:3]), 
  date = seq(as.Date('2012/01/01'), as.Date('2012/12/31'), by = 1) )

all_data[['ed_visits']] <- rpois(nrow(all_data), lambda = 5)



# using plyr

library(plyr)

by_date_plyr <- ddply(all_data, .(date), summarize, visits = sum(ed_visits))


# using data.table
library(data.table)
all_DT <- data.table(all_data)
by_date_dt <- all_DT[, list(visits = sum(ed_visits)), by = 'date' ]

# using aggregate
by_date_base <- aggregate(ed_visits ~ date, data = all_data, sum)

【讨论】：