将 writeOGR 与 rpy2 一起使用答案

【问题标题】：Using writeOGR with rpy2将 writeOGR 与 rpy2 一起使用
【发布时间】：2020-07-20 18:41:31
【问题描述】：

我正在尝试使用从 Python 3.8 调用的 R 来使用 writeOGR。

import rpy2.robjects as ro

.....
ro.r('ttops <- .....')
ro.r('writeOGR(obj=ttops, dsn="T:/Internal/segmentation", layer="test", driver="ESRI Shapefile")')

错误：

R[write to console]: Error in writeOGR(obj = ttops, dsn = "T:/Internal/LiDAR/crown_segmentation",  : 
  could not find function "writeOGR"

Traceback (most recent call last):
  File "C:/Users/david/PycharmProjects/main.py", line 7, in <module>
    main()
  File "C:/Users/david/PycharmProjects/main.py", line 4, in main
    R_Packages().process()
  File "C:\Users\david\PycharmProjects\model_testing\r_methods.py", line 17, in process
    ro.r('writeOGR(obj=ttops, dsn="T:/Internal/segmentation", layer="test", driver="ESRI Shapefile")')
  File "C:\Users\david\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\rpy2\robjects\__init__.py", line 416, in __call__
    res = self.eval(p)
  File "C:\Users\david\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\rpy2\robjects\functions.py", line 197, in __call__
    return (super(SignatureTranslatedFunction, self)
  File "C:\Users\david\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\rpy2\robjects\functions.py", line 125, in __call__
    res = super(Function, self).__call__(*new_args, **new_kwargs)
  File "C:\Users\david\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\rpy2\rinterface_lib\conversion.py", line 44, in _
    cdata = function(*args, **kwargs)
  File "C:\Users\david\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\rpy2\rinterface.py", line 624, in __call__
    raise embedded.RRuntimeError(_rinterface._geterrmessage())
rpy2.rinterface_lib.embedded.RRuntimeError: Error in writeOGR(obj = ttops, dsn = "T:/Internal/segmentation",  : 
  could not find function "writeOGR"

我是否遗漏了什么或者这是 rpy2 的限制？如果是限制，那么使用 Python 编写 R 数据的 shapefile 的替代方法是什么？

【问题讨论】：

你确实安装了GDAL，不是吗？
我刚升级到python 3.8。 pip install gdal 出错。将为此打开新主题并告知是否解决了以前的问题。
获取二进制文件gdal
对不起，我下载了 3.1.2 并解压。它应该在哪里/我需要在环境变量中引用它吗？
我是 ubuntu，自从我构建 Windows 以来已经有好几年了。我会使用二进制文件并让我的 r2py 工作。

标签： r rpy2

【解决方案1】：

有一个我不需要在 R 中定义但在 Python 中需要的库：

ro.r('library(rgdal)')

【讨论】：