导入 rpy2.objects 出现错误：无法初始化 JiT答案

【问题标题】：importing rpy2.objects gives error: unable to initialize the JiT导入 rpy2.objects 出现错误：无法初始化 JiT
【发布时间】：2021-11-09 18:43:02
【问题描述】：

我正在尝试在 python 环境中合并一些 R 代码。我成功导入了rpy2 包。但是，当我尝试导入rpy2.objects时出现错误

from rpy2.robjects import pandas2ri

我收到以下错误

Error in glue(.Internal(R.home()), "library", "base", "R", "base", sep = 
.Platform$file.sep) : 
  4 arguments passed to .Internal(paste) which requires 3
Error: could not find function "attach"
Error: object '.ArgsEnv' not found
Fatal error: unable to initialize the JIT
Restarting kernel...

我在 SE here here 和 here 中找到了一些相关问题。但是，它们似乎都不起作用。

【问题讨论】：

我正在尝试加载包，例如pandas2ri、anndata2ri。但是，它给出了错误。

标签： python r pandas rpy2

【解决方案1】：

形成我收集的内容：如果您的机器上安装了 R，它将自动使用系统的 R 安装，而不是 rpy2 所需的版本。省略我刚刚添加的

import os
os.environ['R_HOME'] = '/Users/<your user>/anaconda3/envs/<env name>/lib/R'

在我从 rpy2 导入任何内容之前。如果它不起作用，您可能必须从您的计算机上完全卸载 R。

【讨论】：