导入 rpy2.robjects 给出错误

Question

我有一个包含 1000 万条记录的数据。我有一个 R 代码，需要使用 3000 次迭代来估计模型的系数。在这些数据上运行 R 代码非常耗时，有时我的系统会挂起。我正在使用具有 4 GB 内存的 Windows 8.1-64 位版本。 为了减少时间，我想将 R 与 Python 集成。虽然我对 R 有一定的了解，但我对 Python 完全陌生。我发现 rpy2 可以用来从 python 调用 R（我有 python 版本 3.4.1）。 我做了以下事情：

导入 rpy2

将 rpy2.robjects 导入为 robjects

但是是给出以下错误：

Traceback（最近一次调用最后一次）： 文件“C:\Python34\lib\site-packages\rpy2\rinterface__init__.py”，第 29 行，在 0，win32con.KEY_QUERY_VALUE） pywintypes.error: (2, 'RegOpenKeyEx', '系统找不到指定的文件')

在处理上述异常的过程中，又发生了一个异常：

Traceback（最近一次调用最后一次）： 文件“”，第 1 行，在 将 rpy2.robjects 导入为 robjects 文件“C:\Python34\lib\site-packages\rpy2\robjects__init__.py”，第 15 行，在 导入 rpy2.rinterface 作为 rinterface 文件“C:\Python34\lib\site-packages\rpy2\rinterface__init__.py”，第 32 行，在 除了 ImportError(ie): NameError: 名称 'ie' 未定义

我不明白为什么会出错。如何克服错误。

但是，如果我执行以下操作，它的工作原理：

从 rpy2 导入 *

如果有人详细解释如何从 Python 调用 R 并为我的问题提供解决方案，那将非常有帮助。 任何其他关于如何在 R 中以更短的时间运行大数据的解决方案也将受到赞赏。 提前致谢！

Answer 1

我遇到了类似的问题，因为我的环境设置不正确，import win32api 会引发ImportError: DLL load failed: The specified module could not be found。通过将包含我的python.exe 的文件夹添加到我的PATH 来修复它。

请注意，异常 NameError: name 'ie' is not defined 是 rpy2 中的一个错误，它隐藏了实际异常，由无法导入 win32api 或 win32con 触发。

但是我后来又遇到了另一个异常 (RuntimeError: R_HOME not defined)，所以我最终按照另一个答案中的建议添加了一个 R_HOME 变量 (= C:\Program Files\R\R-3.1.2)（而且我也收到了 Unable to unlink tempfile 警告，它估计还没修复，见rpy2 windows Unable to unlink tempfile和https://bitbucket.org/lgautier/rpy2/issue/132/rpy2-windows-unable-to-unlink-tempfile)

Answer 2

使用 Python 2.7 和 R3.1.1 在 Win7 x64 中运行时遇到完全相同的问题

1) 安装pywin32：http://sourceforge.net/projects/pywin32/
2）添加环境变量R_HOME：[R的路径，不是/Rx.x/bin]

在导入时我仍然遇到“无法取消链接临时文件”的问题，但我能够完成此处概述的一些演示：http://rpy.sourceforge.net/rpy2/doc-dev/html/introduction.html