无随机效应结构规范的非线性混合模型答案

【问题标题】：Nonlinear mixed model without random effects structure specification无随机效应结构规范的非线性混合模型
【发布时间】：2019-07-22 19:56:47
【问题描述】：

我想使用 nlme R 包来拟合仅具有固定结构规范的非线性模型。

model <- nlme(y ~ Asym/(1+exp((xmid-x)/scal)),
                      data = data,
                      fixed = list(Asym + xmid + scal ~ treatment))
                      #random =  Asym ~ 1|subject)

但是我收到以下错误：

Error in parse(text = paste("~", paste(nVal, collapse = "/"))) : 
  <text>:2:0: unexpected end of input
1: ~ 
   ^

有没有办法绕过这个问题？任何建议都非常受欢迎。

【问题讨论】：

标签： r mixed-models non-linear-regression nlme

【解决方案1】：

我相信您想要带有 params= 参数而不是 fixed= 的 gnls() 函数（也来自 nlme 包）。试试这个：

model <- gnls(y ~ Asym/(1+exp((xmid-x)/scal)),
                  data = data,
                  params = list(Asym + xmid + scal ~ treatment),
                  start= ...)

FWIW，如果您真的要拟合物流（这不仅仅是您想要做的简化示例），使用 SSlogis() 自启动功能代替你的明确公式...

【讨论】：