SimpleITK 读取 io.ByteIO

Question

我有一个代表上传图像 (.nii) 的 io.ByteIO 对象，有没有办法从中获取 simpleITK 对象？ 一个不好的解决方法是写入文件然后用 simpleITK 读取它

Answer 1

很遗憾，SimpleITK 的 Image IO 不适用于流。它只会从文件中读取。

看起来您可以使用 nibabel 从您的流中读取图像。然后将其转换为numpy数组，再将numpy转换为SimpleITK。这很难看，但至少你不会回到磁盘。

这是一篇关于在 nibabel 中读取流的帖子： https://mail.python.org/pipermail/neuroimaging/2017-February/001345.html

以下是从 nibabel 到 numpy 的方法： How to convert Nifti file to Numpy array?

然后使用 numpy 数组，您可以调用 SimpleITK.GetImageFromArray 来创建 SimpleITK 图像。

这些步骤不会保留任何图像元信息，因此您必须复制图像间距、原点和方向等所有内容。