R中的Kolmogorov-Smirnov检验 - For-loop

Question

我在使用 Kolmogorow-Smirnow-test 比较两组曲线时遇到问题。

我希望程序做的是将曲线 1 的每个变体与曲线 2 的每个变体进行比较。为此，我尝试构建一个遍历曲线 1 的 for 循环，并在该循环内另一个循环遍历曲线 2。

不幸的是，在执行代码时，我收到一条关于

的错误消息

“没有足够的 x 数据”

当我尝试通过手动比较每条曲线的一个变体来运行测试时，它可以工作，所以我认为问题在于两个循环和 KS 测试的组合。

如果有人遇到过类似的错误并且能够解决该问题，我将非常感谢任何有关如何解决它的建议。谢谢！

例如data.frames:

Kurve1 <- structure(list(Punkte = 1:21,
                         Trial.1 = c(105.5, 85.3, 63.1, 54.9, 42, 34.1, 30.7,
                                     24.2, 20.1, 15.7, 14, 11, 9.3, 7.2, 6.6,
                                     5.3, 4.2, 3.3, 2.6, 1.8, 0.9),
                         Trial.2 = c(103.8, 85.2, 64.3, 54.1, 41.8, 35.9, 29,
                                     23.7, 20.2, 15.9, 13.5, 11, 9.3, 7.3, 6.4,
                                     5.5, 4.3, 3.4, 2.5, 1.9, 0.9),
                         Trial.3 = c(104.8, 87.2, 64.9, 52.8, 40.8, 35.6, 29.1,
                                     24.5, 20.4, 16.2, 13.7, 11.2, 9.2, 7.5,
                                     6.4, 5.5, 4.2, 3.5, 2.5, 1.8, 0.9),
                         Trial.4 = c(106.9, 83.9, 67.1, 55.1, 44.1, 34.1, 29.3,
                                     22.9, 19.4, 16.7, 13.6, 10.8, 9.4, 7.4,
                                     6.1, 5.6, 4.4, 3.5, 2.4, 1.9, 0.9),
                         Trial.5 = c(104.8, 84.3, 68.7, 54.8, 45.3, 35.2, 28.9,
                                     23.1, 20.1, 16.9, 13.3, 11, 9.6, 7.1, 6.3,
                                     5.4, 4.5, 3.4, 2.3, 2, 0.9)),
                    class = "data.frame", row.names = c(NA, -21L))

Kurve2 <- structure(list(Punkte = 1:21,
                         Trial.1 = c(103.5, 81.2, 66.2, 54.5, 45.1, 39.1, 30.9,
                                     27, 21.9, 19.3, 16.6, 14.9, 12.9, 11, 10.1,
                                     9.2, 8, 7.1, 6.3, 6.2, 5),
                         Trial.2 = c(104, 81, 66.9, 55.2, 46, 38.7, 31.2, 27.3,
                                     22.3, 20, 17.2, 15.2, 12.9, 11.1, 10.2,
                                     9.1, 8, 7.1, 6.4, 5.9, 5),
                         Trial.3 = c(103.9, 81.9, 67.2, 53.8, 45.4, 38.5, 31.5,
                                     26.8, 22.2, 19.8, 17.4, 15.1, 13, 10.9,
                                     10.1, 9.2, 8.1, 7.1, 6.4, 6, 4.9),
                         Trial.4 = c(104.2, 84.1, 68.7, 55.4, 45.1, 36.3, 32,
                                     26.9, 22.8, 19.8, 16.8, 14.8, 13.2, 10.9,
                                     10.3, 9.1, 8.2, 7.2, 6.3, 6.1, 5),
                         Trial.5 = c(103.8, 83.2, 69.2, 55.7, 44.8, 36.4, 31.4,
                                     26.7, 22.1, 18.9, 16.9, 14.4, 13, 11.1,
                                     10.2, 9, 7.9, 7, 6.3, 6.1, 5.1)),
                    class = "data.frame", row.names = c(NA, -21L))

我用于循环的代码：

for(i in 1:ncol(Kurve1)){
   for(j in 1:ncol(Kurve2)){
      ks.test(Kurve1$Trial.[i], Kurve2$Trial.[j], alternative = "greater")
   }
   }

Answer 1

这将起作用：

for(i in 1:(ncol(Kurve1) - 2)){
  for(j in (i + 1):(ncol(Kurve2) - 1)){
    print(paste0("Trial.", i, " - Trial.", j))
    ks_result <- ks.test(Kurve1[, paste0("Trial.", i)],
                         Kurve2[, paste0("Trial.", j)],
                         alternative="greater")
    print(ks_result)
  }
}

解释：

1. 由于对同一列运行 KS 测试没有意义，同时对 Trial.1 ~ Trial.2 和 Trial.2 ~ Trial.1 等运行也没有意义，因此您必须运行您的外部for 循环从1 到最后一个（(ncol(Kurve1) - 2)）索引，用于Trial.* 列，并且您必须从下一个索引运行内部for 循环，因为外部循环具有（@987654329 @) 到 Trial.* 列的最后一个索引 ((ncol(Kurve2) - 1))。

2. 你不能粘贴像Trial.[i]这样的字符串，你必须使用paste函数。与 Kurve1$paste0("Trial.", i) 符号不起作用一样，您必须使用提取运算符 [ 来获取您需要的列 (Kurve1[, paste0("Trial.", i)])

3. 在（嵌套的）for 循环中，ks.test 静默运行，添加了print 以便能够查看结果。我还添加了一行 print(paste0("Trial.", i, " - Trial.", j)) 来用它所属的列标记实际结果。