【发布时间】:2012-04-27 10:15:03
【问题描述】:
谁能给我一个关于如何以及何时在后缀树中创建后缀链接的示例?
如果我的字符串是ABABABC,但如果这样更好,请使用不同的示例。
希望能提供一些图片来说明每一步。
非常感谢。
【问题讨论】:
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请参考stackoverflow.com/questions/9452701/…>
标签: algorithm suffix-tree
谁能给我一个关于如何以及何时在后缀树中创建后缀链接的示例?
如果我的字符串是ABABABC,但如果这样更好,请使用不同的示例。
希望能提供一些图片来说明每一步。
非常感谢。
【问题讨论】:
标签: algorithm suffix-tree
要理解这一点,首先回想一下有三种节点 在后缀树中:
在下图中,ABABABC 的后缀树中,黄色
圆圈是根,灰色、蓝色和绿色是内部的
节点,黑色的小节点是叶子。
有两点需要注意:
内部节点总是有超过 1 个出边。那是, 内部节点标记树中发生分支的部分。
在涉及重复字符串的地方发生分支,并且仅 那里。对于任何内部节点 X,从 root 到 X 必须在输入字符串中至少出现 次 因为有来自 X 的外向边。
示例: 指向蓝色节点的字符串是ABAB。确实,
此字符串在输入字符串中出现两次:在位置 0 和
位置 2。这就是蓝色节点存在的原因。
关于后缀链接:
如果通向某个内部节点 X 的字符串 s 更长 超过 1 个字符,相同的字符串减去第一个字符 (称之为 s-1)也必须在树中(它是 毕竟,后缀树,所以它的任何字符串的后缀必须是 也在树上)。
示例: 设 s=ABAB,通向蓝色节点的字符串。然后
删除第一个字符后,s-1 为BAB。和
事实上,该字符串也在树中找到。它通向绿色
节点。
如果某个字符串 s 导致一个内部节点,它的缩短 版本 s-1必须通向一个内部节点(调用 它也是 X-1)。为什么?因为 s 必须至少出现两次 输入字符串,因此 s-1 必须至少出现多次 (因为它是 s 的一部分:无论 s 出现在哪里, s-1 也必须出现)。但如果 s-1 在输入字符串中出现多次,那么一定有 它的内部节点。
在任何此类情况下,将 X 连接到 X-1 的特殊链接是 后缀链接。
注意:由于上述 (1) 和 (2),每个内部节点 X 从根到 X 的标签超过 1 个字符必须有一个 后缀链接到另一个内部节点。
示例:
这是和以前一样的后缀树;虚线表示 后缀链接。如果从蓝色节点开始,按照后缀 从那里链接(从蓝色到绿色,到第一个灰色,到第二个灰色), 并查看从根到每个节点的字符串,您将 看到这个:
ABAB -> BAB -> AB -> B
(blue) (green) (gray1) (gray2)
这就是为什么它们被称为后缀链接(整个序列是 称为后缀链)。
它们有什么用?
它们对许多事情都有好处。然而,他们扮演一个 Ukkonen's algorithm for suffix tree construction 中的特殊角色,特别是 在 Rule 3 中描述:插入最后一个字符后 在某个点 X 的某些后缀 s 中,算法需要插入 后缀 s-1 在 O(1) 时间内的最后一个字符。在 为了做到这一点,它使用后缀链接直接跳转到该位置 X-1 并进行插入。
但是,请注意,没有必要将后缀链接放在后缀树中。它们不是后缀树定义的一部分——它们只是一些构造或使用后缀树的算法使用的特殊链接。
关于单字符节点:如果内部节点 X 的字符串(即从根到 X 的路径上的字符串)仅包含一个字符怎么办?根据上面的定义,X 没有后缀链接。但是,您可以假设如果它有一个后缀链接,它将指向根节点。此外:根据上述定义,如果内部节点没有后缀链接,则它必须是单字符节点,因此您始终可以假设,如果内部节点不存在后缀链接,则它必须是单字符节点。字符节点,因此表示 s-1 后缀的节点就是根节点。 (在这种情况下,某些算法实际上可能会添加指向根节点的显式后缀链接。)感谢 j_random_hacker 对此的评论。
【讨论】: