从 jupyter docker stack 在 docker 中安装 %%R cell magic答案

【问题标题】：install %%R cell magic in docker from jupyter docker stack从 jupyter docker stack 在 docker 中安装 %%R cell magic
【发布时间】：2019-07-20 07:24:12
【问题描述】：

我尝试从 docker 堆栈安装 datascience jupyter docker image（标签 45b8529a6bfc，上次更新时间为 2019 年 2 月 14 日）。我的整个 dockerfile：

FROM jupyter/datascience-notebook:45b8529a6bfc
USER $NB_UID

当我打开一个带有 R 内核的新 Jupyter 笔记本时，该笔记本工作正常。当我在 ipython 笔记本中尝试 %%R 单元魔法时，它不起作用：

%%R
3+4
UsageError: Cell magic `%%R` not found.

我在各种 stackoverflow 答案和互联网搜索中闲逛，尝试安装 rpy2（它已经安装）。没用。

建议？

【问题讨论】：

标签： docker jupyter-notebook ipython rpy2

【解决方案1】：

在尝试使用之前加载 jupyter 扩展：

%load_ext rpy2.ipython

【讨论】：

谢谢！你的答案没有用，但它让我找到了答案。

【解决方案2】：

我按照@lgautier 的建议尝试了%load_ext rpy2.ipython，得到了错误消息No module named 'simplegeneric'。一旦我 pip 安装了 simplegeneric，一切正常，我不需要 load_ext 语句。

不知道为什么 dockerfile 没有安装 simplegeneric，但是你有它。

【讨论】：