同一控制下的企业合并，长期股权投资成本与支付账面之间的差额计入资本公积

原因:

同一控制下的企业合并可以看成是以价值较低的权益性债券买入价值较高的长期股权投资。

被合并企业取得合并企业的权益性债券，相当于对合并企业进行投资，出资额就是长期股权投资。
合并企业取得价值较高的长期股权投资，其差额就是资本公积---股本溢价/资本溢价。