python中scipy模块中,有一个模块叫sparse模块,就是专门为了解决稀疏矩阵而生。本文的大部分内容,其实就是基于sparse模块而来的
导入模块:from scipy import sparse
二、七种矩阵类型
- coo_matrix
- dok_matrix
- lil_matrix
- dia_matrix
- csr_matrix
- csc_matrix
- bsr_matrix
三、coo_matrix
coo_matrix是最简单的存储方式。采用三个数组row、col和data保存非零元素的信息。这三个数组的长度相同,row保存元素的行,col保存元素的列,data保存元素的值。一般来说,coo_matrix主要用来创建矩阵,因为coo_matrix无法对矩阵的元素进行增删改等操作,一旦矩阵创建成功以后,会转化为其他形式的矩阵。data = [5,2,3,0]
>>> row = [2,2,3,2] >>> col = [3,4,2,3] >>> c = sparse.coo_matrix((data,(row,col)),shape=(5,6)) >>> print c.toarray() [[0 0 0 0 0 0] [0 0 0 0 0 0] [0 0 0 5 2 0] [0 0 3 0 0 0] [0 0 0 0 0 0]]
稍微需要注意的一点是,用coo_matrix创建矩阵的时候,相同的行列坐标可以出现多次。矩阵被真正创建完成以后,相应的坐标值会加起来得到最终的结果。
四、dok_matrix与lil_matrix
dok_matrix和lil_matrix适用的场景是逐渐添加矩阵的元素。
doc_matrix的策略是采用字典来记录矩阵中不为0的元素。自然,字典的key存的是记录元素的位置信息的元祖,value是记录元素的具体值。
>>> import numpy as np >>> from scipy.sparse import dok_matrix >>> S = dok_matrix((5, 5), dtype=np.float32) >>> for i in range(5): ... for j in range(5): ... S[i, j] = i + j ... >>> print S.toarray() [[ 0. 1. 2. 3. 4.] [ 1. 2. 3. 4. 5.] [ 2. 3. 4. 5. 6.] [ 3. 4. 5. 6. 7.] [ 4. 5. 6. 7. 8.]]