欢迎关注”生信修炼手册”!

从名称可以看出,circR2Disease是一个疾病相关的环状RNA数据库,网址如下

http://bioinfo.snnu.edu.cn/CircR2Disease/

该数据库中包含以下3个物种的相关信息

  1. human

  2. mouse

  3. rat

最新版收录了661个环状RNA,100种疾病,739个环状RNA和疾病之间的关联数据。
通过导航栏的Browser菜单,可以根据以下两种类型查看相关数据

  1. circRNAs

  2. Diseases

以肺癌为例,结果如下所示

circR2Disease:疾病相关的环状RNA数据库

该数据库中的记录都是从文献中整理得到的,如果环状RNA来自circBase数据库,会给出对应的超链接,否则只会给出文献中的命名。

和同类型的数据库一样,都会给出疾病的名称,检测的方式,环状RNA在患病者中的表达趋势,相关文献的pubmed id等信息。

通过这种类型的数据库,我们不仅可以检索环状RNA和疾病之间的关系,还可以构建环状RNA和疾病之间的互作网络,示意如下

circR2Disease:疾病相关的环状RNA数据库

上图中矩形代表疾病名称,圆形代表环状RNA,通过不断丰富环状RNA和疾病之间的网络,可以对环状RNA在疾病中的作用有一个更加清楚,深入的理解。

·end·

—如果喜欢,快分享给你的朋友们吧—

扫描关注微信号,更多精彩内容等着你!

circR2Disease:疾病相关的环状RNA数据库

相关文章:

  • 2021-04-18
  • 2021-11-14
  • 2021-07-12
  • 2021-06-06
  • 2021-08-03
  • 2021-09-10
  • 2021-07-01
  • 2021-05-12
猜你喜欢
  • 2021-07-28
  • 2021-10-09
  • 2021-06-18
  • 2021-09-14
  • 2021-08-12
  • 2021-05-06
  • 2021-09-25
相关资源
相似解决方案