遍历大列表，找到与基因最匹配的同源物

【问题标题】：Looping over large List, finding best fitting homologe to gene遍历大列表，找到与基因最匹配的同源物
【发布时间】：2019-06-11 15:38:14
【问题描述】：

我有一个很大的基因列表，我想查找同源物。

我还有一个带有潜在同源物的大型数据框。此 Dataframe 的第十列继承了一个数字，描述了拟合。数字越大越好。

我正在尝试遍历这个庞大的基因列表。

对于列表中的每个独特基因，我想选择最适合的同源基因。

输出应该是一个数据框，每个基因一行，描述最合适的同源物。

【问题讨论】：

【解决方案1】：

Tidyverse 解决方案，假设您有一个列，每个基因都有一个 gene_id，并且拟合分数在一个名为 score 的列中：

library(tidyverse)

df %>% group_by(gene_id) %>% filter(score == max(score)) %>% ungroup()

【讨论】：

这似乎是一个整洁的解决方案 =，D。但是每当我在安装后尝试将包加载到库中时，都会出现以下错误。库中的错误（tidyverse）：没有名为“tidyverse”的包
@JonasEngelhardt 你实际上只需要 dplyr 包而不是整个 tidyverse。