【问题标题】:install packages in R在 R 中安装包
【发布时间】:2021-04-07 04:48:10
【问题描述】:

在寻求您的帮助之前,我会在 StackOverflow 上搜索可能的解决方案。不幸的是,它们对我不起作用。 我想在 Rstudio 中运行一个应用程序。大多数软件包运行 R>4.0 但 BiocInstaller(我需要,因为它是一个旧应用程序)运行 R 3.5-3.99 ..... 我该做什么。如果我安装 R >4,我会遇到 BiocInstaller 的问题。如果我安装 R 3.5.3,我的其他软件包有问题....请帮助 我尝试了全新的安装、升级、降级,以不同的方式手动安装,而不是......请

【问题讨论】:

    标签: r bioconductor


    【解决方案1】:

    你在找这个吗?

    if(!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)){
      install.packages("BiocManager")
    }
    BiocManager::install(version = "3.11")
    

    查看Bioconductor - install 页面。

    【讨论】:

    • 非常感谢您的回答。我已经尝试过了,我犯了 2 个错误。 1)错误:Bioconductor版本'3.11'需要R版本'4.0';请参阅bioconductor.org/install(我有版本 4)2)包“BiocInstaller”不可用(对于 R 版本 3.6.3)
    • @Adam 试试,例如,version = "3.08"。或"3.07",见Boiconductor releases
    • 谢谢。我遵循 3.10 版本。我收到 16 条警告,例如警告:无法删除先前安装的软件包“摘要”警告:已恢复“摘要”请我应该如何处理它们
    • @Adam 请参阅this SO post,尤其是this answer
    • @Adam 在 Bioconductor 版本中,链接在我的第二条评论中,据说 R3.5 需要 BiocManager 3.07 或 3.08。你试过了吗?
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