如何在小插图中包含 inst/REFERENCES.bib答案

【问题标题】：How to include inst/REFERENCES.bib in vignette如何在小插图中包含 inst/REFERENCES.bib
【发布时间】：2021-01-01 01:22:53
【问题描述】：

在我的计算机上运行 devtools::check() 我可以使用 .bib 文件的绝对路径强制构建我的包而不会出错。但是由于我在包小插图中包含了我的所有引用并试图指向包含所有 bibtex 引用的 .bib 文件，所以我还没有使用 GitHub Actions 构建包（绝对路径没有意义）。我正在寻求有关如何指向小插图 YAML 标头中的 .bib 文件的建议。

inst/ 目录中 .bib 文件的位置允许我使用 .Rd 文档中的引用来获取包（如此处建议：https://geobosh.github.io/Rdpack/#org88fb0a7），所以我最感兴趣的解决方案可以让我引用该位置中的文件，而不是将其保存在备用目录中。

我的 YAML 标头内容如下：

---
title: "Using_my_package"
output: rmarkdown::html_vignette
bibliography: "where/I/keep/my/package/inst/REFERENCES.bib"
latex_engine: xelatex
vignette: >
  %\VignetteIndexEntry{Using_my_package}
  %\VignetteEngine{knitr::rmarkdown}
  %\VignetteEncoding{UTF-8}
  %\SweaveUTF8
  
---

我也试过

 bibliography: `'r system.file("inst", "REFERENCES.bib", package="mypackage")`'`

如何在 YAML 标头中使用相对路径，以便从任何位置构建小插图？

【问题讨论】：

为什么不将 bibfile 存储在 vignettes 文件夹中？这适用于我的包，您可以在 YAML 标头中使用 bibliography: REFERENCES.bib。
谢谢@J_F！这是否会导致在您的函数的 roxygen cmets 中包含引用时出现任何问题？我按照Rdpack 包的说明进行操作，该说明将它们保存在inst/ 文件夹中。 geobosh.github.io/Rdpack/#org88fb0a7

标签： r package knitr vignette

【解决方案1】：

看来解决方案是在 system.file 调用中省略 "inst"。感谢@Martin Morgan here 的评论。工作 YAML 标头现在读取

bibliography: `'r system.file("REFERENCES.bib", package="mypackage")`'`

并且在所有使用 GitHub Actions 的系统以及我的本地计算机上构建成功。

【讨论】：