@miraculixx 的answer 是正确的,但它假定您已经安装了CDF C Library。
如果您在 SO 上找到此问题之前甚至不知道 CDF 文件格式是什么,这里有一个易于遵循的指南。
1.下载最新版本的 CDF C 库:
您可以在link 找到最新的稳定版本。使用wget 获取源代码,然后提取它。 注意:下面会在当前文件夹./创建一个目录,如果你想在不同的路径下载代码,请务必更改下面的代码。
wget -r -l1 -np -nd -nc http://cdaweb.gsfc.nasa.gov/pub/software/cdf/dist/latest-release/linux/ -A cdf*-dist-all.tar.gz
tar xf cdf*-dist-all.tar.gz -C ./
cd cdf*dist
2。安装所有依赖项:
SpacePy 和 CDF 库有几个依赖项(正如@Michal Dyzma 所指出的)。您可以使用conda 或pip 和apt 安装它们。
pip install numpy scipy h5py matplotlib networkx
apt install build-essential gfortran libncurses5-dev
3.编译 C 库:
您应该已经下载了一个README.install 文件,其中包含的有关此步骤的详细信息比我提供的要多得多。两分钱是您要检查哪些编译变量对于您的系统和需求是必需/可选的。
make all.help
我将使用 GNU C 编译器为 Linux 构建发行版。我对 FORTRAN 界面不感兴趣,我的操作系统支持可共享库。我想安装允许使用基于命令行的交互式 CDF 工具的基于 Curses 的工具包程序(这就是我们在步骤 2 中安装 libncurses5-dev 依赖项的原因)。因此,这是最终的 make 命令:
make OS=linux ENV=gnu CURSES=yes FORTRAN=no UCOPTIONS=-O2 SHARED=yes -j4 all
make install #no sudo
安装应该运行顺利并添加./bin、./include和./lib子目录中的所有文件。
4.设置环境变量:
./bin 中应该有一个名为 definitions.B 的文件,它会自动为您执行此操作,使用 chmod+x 使其可执行,然后将以下行添加到您的 ~/.bashrc(注意: 1)我假设您将库安装在路径$HOME/Libraries/; 2).后面有个空格):
. $HOME/Libraries/cdf/cdf36_3-dist/bin/definitions.B
重要提示:
上面的文件在 第 68 行 有一个错误,而不是附加到环境变量 LD_LIBRARY_PATH 它会覆盖它。修复很简单,将 line 68 替换为以下内容:
export LD_LIBRARY_PATH=$HOME/Libraries/cdf/cdf36_3-dist/lib:$LD_LIBRARY_PATH
如果由于某种原因definitions.B 不存在,只需添加以下内容:
export CDF_BASE=$HOME/Libraries/cdf/cdf36_3-dist
export CDF_INC=$CDF_BASE/include
export CDF_LIB=$CDF_BASE/lib
export CDF_BIN=$CDF_BASE/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$CDF_BASE/lib:$LD_LIBRARY_PATH
5.你都准备好了,去做好事吧:
假设您使用 pip 安装了spacepy,以下内容应该可以立即使用:
from spacepy import pycdf
cdf = pycdf.CDF('/path/to/file.cdf')
print(cdf)