【发布时间】：2010-08-04 14:19:51
【问题描述】：
我想运行类似 BLAST 算法的东西来查询一个大型的 unicode 字符串数据库。大多数比对软件（如 BLAST）都需要核苷酸或蛋白质字符串作为输入。但我的输入可能包含任何 Unicode 字符。有人知道可以让我这样做的软件吗？评分矩阵可能只是单位矩阵（没有部分匹配。）
我尝试过 Needleman-Wunsch 和 Smith Waterman，但就我的目的而言，它们太慢了。我需要查询一个大型数据库，就像在 BLAST 中一样。
谢谢！
【问题讨论】：
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我不确定我是否理解目的；对于生物信息学问题，您可能还想尝试biostar.stackexchange.com
标签： translation alignment information-retrieval bioinformatics blast