在 RDF 中表示网格/矩阵的最简单方法是什么？

Question

我不知道如何表达这个问题，所以如果有更好的术语或现有答案指向我！这是我第一次使用 RDF 设计任何东西。

我正在建立一个小型个人知识库来跟踪实验室中的项目，但我不确定如何最好地编码 2D 位置。到目前为止，我想出的唯一想法是让 everything 成为一个容器。例如，如果我有一个 96 孔板，它将是一个有 12 列和 8 行的大容器，每个容器都是带有孔的容器，每个孔都是一个容器，里面装着我感兴趣的东西跟踪。

看起来足够灵活，可以处理很多实际情况，但是查询它有点麻烦。为了在板p0001 的井B7 中获得应变，它类似于：“描述在井w 中的应变s，在行r 和列c 中，其中r 和c 在板p 中，p 标记为p0001，c 标记为7，r 标记为B”（请原谅可怕的伪SPARQL)

有没有更简单的方法？我想这在很多涉及库存的商业环境中都会出现，所以人们可能已经弄清楚了。

我不确定的另一件事是对索引本身进行编码。我应该将它们标记为文字吗？

编辑：盘子看起来like this。

Answer 1

对于正确的答案，这可能过于宽泛，但我认为有几个选择。我将从实际上与编码网格有关的内容开始，但以我认为实际上最合适的内容结束。

使用所有数组索引对结构进行编码

RDF 中的容器，除了与它们类似的列表和结构外，不会获得有序存储。 RDF 只是一个 set 三元组。这意味着如果您想维护任何类型的基于索引的引用，那么您需要直接对其进行编码。这不是太难。假设我们有一个类似

的数组

[[a, b, c],
 [d, e, f]]

然后我们可以很容易地做这样的事情：

@prefix : <urn:ex:>

:array :hasElement [ :value :a ; :row 0 ; :column 0 ] ,
                   [ :value :b ; :row 0 ; :column 1 ] ,
                   [ :value :c ; :row 0 ; :column 2 ] ,
                   [ :value :d ; :row 1 ; :column 0 ] ,
                   [ :value :e ; :row 1 ; :column 1 ] ,
                   [ :value :f ; :row 1 ; :column 2 ] .

然后您可以轻松地使用 SPARQL 查询，例如：

prefix : <urn:ex:>

select ?value where {
  :array :hasElement [ :value ?value ; :row 1 ; :column 2 ]
}

使用隐式索引编码结构

您还可以使用诸如 RDF 列表（它们是单链表）之类的结构并按位置查找元素，就像您可以计算列表中元素的位置一样。我在对Is it possible to get the position of an element in an RDF Collection in SPARQL? 的回答中对此进行了描述，但是，这可能会相当低效，我怀疑您是否愿意这样做。

使用底层语义编码结构

但是，如果您有一个表格或数据网格，那么行和列实际上可能 意味着 什么；它可能不仅仅是一个价值网格。在这种情况下，您可能可以以更具语义意义的方式表示数据。例如，如果您有这样的表：

Name    Age    Height
---------------------
John     45        78
Mary     30        60
Susan    25        59

然后，一种“常规”方式来表示这一点，即每一行都有一个对应于每一列的属性：

:row1 a :Row ; :name "John"  ; :age 45 ; :height 78 .
:row2 a :Row ; :name "Mary"  ; :age 30 ; :height 60 .
:row3 a :Row ; :name "Susan" ; :age 25 ; :height 59 .

这或多或少是Defining N-ary Relations on the Semantic Web 中给出的方法，如果您将每一行视为关系的一个实例。 A Direct Mapping of Relational Data to RDF 也很相关。

适合您的用例

由于您的用例（我必须查找“孔板”是什么），看来您实际上可能想要这些数字索引，因此第一种和第三种方法的混合可能是您想要的。

似乎足够灵活，可以处理很多实际情况，但查询 这有点麻烦。为了获得板 p0001 的 B7 孔中的应变， 它可能类似于：“描述井 w 中的应变 s， 它位于 r 行和 c 列，其中 r 和 c 在板 p 中， p 标记为 p0001，c 标记为 7，r 标记为 B”（请原谅 可怕的伪 SPARQL）

我不认为这一切都那么麻烦。根据您标记列和行的方式，它可能类似于：

select ?strain where {
  ?plate rdfs:label "p0001" ;
         :hasWell [ :row "7" ;             #-- or :row/rdfs:label "7", or ...
                    :col "B" ;             #-- or :col/rdfs:label "B", or ...
                    :contains ?strain ] .
}