为什么 lsf 命令 bjobs 不能在 linux shell 中正确执行答案

【问题标题】：Why lsf command bjobs can not be executed correctly in linux shell为什么 lsf 命令 bjobs 不能在 linux shell 中正确执行
【发布时间】：2019-12-31 13:14:27
【问题描述】：

在我的项目中，我编写了一个 linux shell 脚本。我想区分节点作业是否在 lsf 中运行。 LSF 是 IBM 产品。

我有一个文件Date.log，内容是这样的：

 133462 bio-yuym 5*r01n42
 141588 eee-leisq 40*r10n43
 142885 phy-zhangy 40*r13n40
 142907 phy-zhangy 40*r13n31
 143545 bio-zouxd r01n07
 143962 phy-xiaoxl 40*r08n38
 143971 eee-leisq 40*r08n53
 144009 phy-muhm 40*r11n51

我的 linux shell 脚本代码是：

cat Date.log | while read LINE     
do
  jobID=`echo $LINE | awk '{print $1}'`
  jobInfo=`bjobs $jobID `

  if [[ $jobInfo =~ "not\ found" ]]
  then
     echo $LINE >> "$Date"-lsffin.log
  else
     echo $LINE >> "$Date"-lsfrun.log
 fi
done

正确的结果应该是两个文件，“$Date”-lsfrun.log的内容应该是：

143545 bio-zouxd r01n07
143962 phy-xiaoxl 40*r08n38

但很不幸，我的屏幕上有消息：

Job <143545> is not found
Job <143962> is not found

“$Date”.lsfrun.log 中为空白。所有内容都在“$Date”-lsfrun.log 中。

为什么 lsf 命令 bjobs 不能在 linux shell 中正确执行？

【问题讨论】：

标签： linux shell lsf

【解决方案1】：

尽管捕获了程序的标准输出，但您仍看到屏幕输出这一事实表明bjobs 正在将这些错误消息写入其标准错误流而不是其标准输出流。那将是完全传统的。

如果你想同时捕获标准输出和标准错误，那么你必须将后者重定向到前者：

jobInfo=`bjobs $jobID 2>&1`

【讨论】：