【问题标题】:R remove borders of pheatmapR删除pheatmap的边界
【发布时间】:2012-10-13 21:48:58
【问题描述】:

我发现pheatmap (pretty heatmap) 包是一种非常好且简单的生成热图的方法。除了正常的heatmap() 命令外,它还会生成一个颜色条,表示每种颜色后面的数量,并且不会包含不需要的heatmap.2 细节。

行和列之间的边框很细。行数少时没问题,但行数较多时,这些边框会使热图不太好。有什么办法可以去掉吗?

根据手册,border_color=NA 应该将其删除,但是当我从输出创建 PDF 文件时,行和列之间仍然存在细边框。

【问题讨论】:

  • 看手册好像你想设置border_color:"heatmap上单元格边框的颜色,如果不应该画边框,使用NA。"
  • 我已经完成了,但是当我输出到 PDF 文件时仍然有一个细边框

标签: r heatmap


【解决方案1】:

边框似乎是 Mac Preview 和 Adob​​e Reader 等 PDF 查看器程序的问题。当热图转换为 TIFF 或 PNG 等图片格式时,它们会被删除。

【讨论】:

    【解决方案2】:

    我遇到了同样的问题; PDF 中的灰色边框线,但 TIFF 或 PNG 中没有。但我发现您可以在 Adob​​e Illustrator 中轻松移除边框线。

    【讨论】:

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