Slurm 脚本和分配核心数量答案

【问题标题】：Slurm Scripts and Assigning Number of CoresSlurm 脚本和分配核心数量
【发布时间】：2021-11-24 19:48:18
【问题描述】：

所以我开始研究一些基本的 HPC 主题。但是，我有一个非常基本的问题： 如何在 slurm 脚本中分配正确（或所需）数量的核心？

我很欣赏这是一个相当基本的问题，但我在网上或教科书中找不到任何可以帮助我克服问题的东西。 slurm脚本的一部分图片：

非常感谢任何帮助。

【问题讨论】：

【解决方案1】：

在您显示的片段中，它有选项

#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=1

这意味着（就 Slurm 而言）您将启动 1 个进程 (--ntasks=1)，该进程可以访问 1 个核心价值的资源 (-cpus-per-task=1)。该进程如何绑定到核心是一个稍微不同的问题，但在大多数 HPC 系统上，这通常意味着调度程序会为您的进程分配 1 个物理核心。

但是，您的片段中也有：

#SBATCH --exclusive
#SBATCH --nodes=1

这些选项通常意味着您要求独占访问单个节点（即只允许您的作业在其上运行）。例如，如果您使用的 HPC 系统上的节点有 64 个物理内核；然后，就目前而言，此示例片段将要求您使用整个节点（64 个核心），但随后指定您只想使用其中 1 个（来自--ntasks=1 和-cpus-per-task=1）。

如果您想更改此设置以要求 32 个进程在 1 个具有独占访问权限的节点上的 32 个内核上运行，您可以使用类似：

#SBATCH --ntasks=32
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --exclusive
#SBATCH --nodes=1

【讨论】：

太棒了。我不知道为什么，但我一直在努力寻找任何能给我如此简洁的答案的东西。非常感谢。