【问题标题】:Boxplot by groups & blocks, with axis-aligned statistics分组和块的箱线图,具有轴对齐的统计信息
【发布时间】:2015-12-23 16:37:18
【问题描述】:

我一直在为按组和时间点块的箱线图构建 GTL 模板。我怀疑 SAS 9.4(TS Level 1M2)中的 GTL 还不完全支持这种多维、轴对齐的 BOXPLOT 和 BLOCKPLOT 组合。

  • 如果我错了,我将不胜感激有关正确方法的建议。
  • 如果我是对的,我欢迎有关或多或少简单的 GTL 解决方法的建议。

下面的代码生成了第一个图,但我真的想要第二个图。换句话说,我希望 BLOCKPLOT 支持与 BOXPLOT(时间点和治疗组)相同的两个 x 轴水平。但是,BLOCKPLOT 只会在 X 轴(时间点)内叠加 CLASS(治疗组)。但是 BOXPLOT 会在块内沿 X 轴分隔 GROUP。

我找不到任何方法可以从 BLOCKPLOT 的“堆栈”方法切换到像 BOXPLOT 这样的“集群”方法。 (我也尝试过 AXISTABLE,但它们的行为类似于 BLOCKPLOT。)

感谢您指出正确的方法或建议解决方法。

我已经看过的代表性讨论:

从 9.4 (TS1M2) 代码绘制,如下:

我想编码的明显操纵的情节:

第一个情节的代码:

/* Set up test data structure, with few seed observations */
  proc sql;
    create table labstruct
      (  mygroup         char(3) label='Treatment Group'
       , myvisitnum      num     label='Visit number'
       , myvisitname     char(8) label='Visit name'
       , labtestname     char(8) label='Name of lab test'
       , labseed         num     label='Lab measurement seed'
       , lablow          num     label='Low end of normal range'
       , labhigh         num     label='High end of normal range'
      )
    ;
    insert into labstruct
      values('A', 1,  'Day 1',  'Test XYZ', 48, 40, 60)
      values('B', 1,  'Day 1',  'Test XYZ', 52, 40, 60)
      values('A', 5,  'Week 1', 'Test XYZ', 50, 40, 60)
      values('B', 5,  'Week 1', 'Test XYZ', 50, 40, 60)
      values('A', 10, 'Week 2', 'Test XYZ', 52, 40, 60)
      values('B', 10, 'Week 2', 'Test XYZ', 48, 40, 60)
    ;
  quit;

  /* Make more obs from the seeds above */
    data labdata;
      set labstruct;

      do repeat = 1 to 20;
        labvalue = labseed + 6*rannor(3297);
        if ranuni(59843)>0.1 then output;
      end;

      label labvalue = 'Lab measurement';
      drop repeat labseed;
    run;


/* Calculate summary stats, and merge onto lab data for use as "block" labels */
  proc summary data=labdata noprint;
    by myvisitnum mygroup;
    var labvalue;
    output out=labstats (drop=_type_) 
           n=n mean=mean std=std;
  run;

  /* Merge summary stats onto lab data, used in GTL template as "block" labels */
  data labdata;
    merge labdata (in=in_data)
          labstats (in=in_stats);
    by myvisitnum mygroup;
    label n      = 'n'
          mean   = 'Mean'
          std    = 'Std Dev';
  run;


proc template;
  define statgraph xalignedstats;
    dynamic _TRT _AVISIT _AVISITN _AVAL _STAT1 _STAT2 _STAT3;

    begingraph / border=false dataskin=none attrpriority=none;

      layout overlay / walldisplay=none ;

        innermargin / align=top separator=false pad=(top=0);
          blockplot x=_AVISITN block=_AVISIT /
                    display=(outline values) valuefitpolicy=split ;
        endinnermargin;

        boxplot x=_AVISITN y=_AVAL /
                group=_TRT groupdisplay=cluster clusterwidth=0.8 ;

        innermargin / align=bottom separator=false pad=(bottom=0);
          blockplot x=_AVISITN block=_TRT / class=_TRT label='Treatment' filltype=alternate;
          blockplot x=_AVISITN block=_STAT1 / class=_TRT label='n' filltype=alternate;
          blockplot x=_AVISITN block=_STAT2 / class=_TRT label='Mean' filltype=alternate;
          blockplot x=_AVISITN block=_STAT3 / class=_TRT label='Std Dev' filltype=alternate;
        endinnermargin;

      endlayout;

    endgraph;
  end;
run;

proc sgrender data=labdata template=xalignedstats;
  dynamic 
          _TRT     ='mygroup'
          _AVISITN ='myvisitnum' 
          _AVISIT  ='myvisitname' 
          _AVAL    ='labvalue'
          _STAT1   ='n'
          _STAT2   ='mean'
          _STAT3   ='std'
          ;
run;

【问题讨论】:

  • 如果您在communities.sas.com 上发布SAS 图表,Sanjay 或DanH 通常会发布。鉴于日期,您可能不会得到太多帮助。
  • SAS 和 Sanjay 不会让人失望 -- even this time of year.

标签: sas boxplot sas-gtl


【解决方案1】:

至少这个核心是可以回答的。如果您使用axistable 而不是blockplot,则可以选择指定classdisplay=cluster,其作用类似于groupdisplay=cluster(为什么名称不同,不知道)。

proc template;
  define statgraph xalignedstats;
    dynamic _TRT _AVISIT _AVISITN _AVAL _STAT1 _STAT2 _STAT3;

    begingraph / border=false dataskin=none attrpriority=none;

      layout overlay / walldisplay=none ;

        innermargin / align=top separator=false pad=(top=0);
          blockplot x=_AVISITN block=_AVISIT /
                    display=(outline values) valuefitpolicy=split ;
        endinnermargin;

        boxplot x=_AVISITN y=_AVAL /
                group=_TRT groupdisplay=cluster clusterwidth=0.8 ;

        innermargin / align=bottom separator=false pad=(bottom=0);
          axistable x=_AVISITN value=_TRT / class=_TRT label='Treatment' classdisplay=cluster colorgroup=_TRT;
          axistable x=_AVISITN value=_STAT1 / class=_TRT label='n'  classdisplay=cluster colorgroup=_TRT;
          axistable x=_AVISITN value=_STAT2 / class=_TRT label='Mean' classdisplay=cluster colorgroup=_TRT;
          axistable x=_AVISITN value=_STAT3 / class=_TRT label='Std Dev' classdisplay=cluster colorgroup=_TRT;
        endinnermargin;

      endlayout;

    endgraph;
  end;
run;

您可能很难(或不可能)正确设置所有格式,例如交替颜色,但这至少是一个开始。例如,您可以考虑使用 colorgroup 使颜色与您的线条颜色相匹配,尽管没有(太多/任何)控制背景填充。

【讨论】:

  • 非常感谢,乔。我错过了轴表上的类显示选项。 GTL 强大而庞大。
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