【问题标题】:Creating list of neighbors from edgelist (Python: accessing tuples with first value specified)从 edgelist 创建邻居列表(Python:访问指定第一个值的元组)
【发布时间】:2017-04-20 00:05:31
【问题描述】:

使用 NetworkX,我获得了描述图中边(顶点对)的元组列表:

G = [(1, 2), (1, 3), (1, 4), (2, 4), (3, 8), (4, 5), (8, 15), (5, 6), (5, 7), (6, 17), (7, 11), (7, 15), (7, 16), (17, 12), (11, 12), (11, 13), (15, 9), (15, 10), (16, 9), (9, 18), (18, 13), (18, 14), (10, 14)]

使用这个列表,我想遍历每个顶点,并找到每个相邻的顶点,但我想按顺序执行此操作。所以我想得到的是一个嵌套列表,其中包含ith 子列表,其中包含顶点i 的每个邻居。

Neighbors = [[2, 3, 4], [1, 4], [1, 8], [1, 2, 5], [4, 6, 7], [5, 17], [5, 11, 15, 16], [3, 15], [15, 16, 18], [14, 15], [7, 12, 13], [11, 17], [11, 18], [10, 18], [7, 8, 9, 10], [7, 9], [6, 12], [9, 13, 14]]

,但它也可以是另一种排序的数据结构。

但是,由于我的图可能包含一百万条边和顶点,我想实现一个例程,它不会循环遍历每个顶点的整个列表,因为我想保持运行时间较低。

有什么方法可以做到这一点吗?非常感谢任何帮助。

【问题讨论】:

  • 不遍历整个列表你知道有多少个顶点吗?

标签: python loops graph networkx metis


【解决方案1】:

您可以按如下方式使用默认字典:

from collections import defaultdict
d = defaultdict(set)

for x, y in G:
    d[x].add(y)
    d[y].add(x)

d
defaultdict(set,
            {1: {2, 3, 4},
             2: {1, 4},
             3: {1, 8},
             4: {1, 2, 5},
             5: {4, 6, 7},
             6: {5, 17},
             7: {5, 11, 15, 16},
             8: {3, 15},
             9: {15, 16, 18},
             10: {14, 15},
             11: {7, 12, 13},
             12: {11, 17},
             13: {11, 18},
             14: {10, 18},
             15: {7, 8, 9, 10},
             16: {7, 9},
             17: {6, 12},
             18: {9, 13, 14}})

您可以将字典转换为列表:

[sorted(d[k]) for k in range(1, max(d.keys())+1)]
[[2, 3, 4],
 [1, 4],
 [1, 8],
 [1, 2, 5],
 [4, 6, 7],
 [5, 17],
 [5, 11, 15, 16],
 [3, 15],
 [15, 16, 18],
 [14, 15],
 [7, 12, 13],
 [11, 17],
 [11, 18],
 [10, 18],
 [7, 8, 9, 10],
 [7, 9],
 [6, 12],
 [9, 13, 14]]

【讨论】:

  • 这行得通!万分感谢。你能解释一下普通字典和默认字典的区别吗?
【解决方案2】:

如果可以访问原始图g,则可以遍历原始边列表(如果没有,可以从G构造g):

[list(v.keys()) for _,e in g.edge.items()]
#[[2, 3, 4], [1, 4], [8, 1], [1, 2, 5], [4, 6, 7], [17, 5], [16, 11, 5, 15], ...]

如果你对dict_keys 没问题,你可以省略list(),这只是一个只读版本的列表:

[v.keys() for _,e in g.edge.items()]
#[dict_keys([2, 3, 4]), dict_keys([1, 4]), dict_keys([8, 1]), ...]

【讨论】:

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