将 Perl 生成的脚本提交给 AGE 时捕获作业 ID

【问题标题】：Captuing job ID when submitting Perl-generated scripts to SGE将 Perl 生成的脚本提交给 AGE 时捕获作业 ID
【发布时间】：2011-04-26 19:39:13
【问题描述】：

Perl 无法打开进出运行的命令管道，这在通过 qsub 提交到 SGE 时会导致问题，因为我丢失了提交的作业 ID。如何将生成的脚本提交给 SGE并获取 SGE 为其分配的作业 ID？

【问题讨论】：

标签： perl qsub sungridengine

【解决方案1】：

这是一个 Perl 常见问题解答：How can I open a pipe both to and from a command?（简短回答：请参阅 IPC::Open2）

另一种方法是使用 shell 中的 I/O 重定向工具来捕获外部程序的输出：

open my $qsub_proc, '|-', "qsub $command $args > some/file";
print {$qsub_proc} $the_input_to_the_command;
close $qsub_proc;

open my $qsub_fh, '<', 'some/file';
my @qsub_output = <$qsub_fh>;
... # now parse @qsub_output to get your job id

【讨论】：