使用带有 qsub 的 for 循环进行批量作业提交

Question

能否告知我如何使用 for 循环到 qsub 文件进行批量作业提交？

目前，这仅在我使用以下命令提交单个文件以提交作业时才有效：

qsub -v /path/to/file.txt script.sh

但是，如果我使用以下命令对文件运行 for 循环：

files=`pwd`/*pattern* (#This gives a list of files containing a certain common title)

for i in $files;
do
qsub -v $i script.sh
done

这总是会因为没有提供 file.txt 的错误而被拒绝。

我已经通过执行以下操作仔细检查了 for 循环中的 $i 是否提供了正确的 file.txt：

for i in $files;
do
echo $i
done

这很好用。因此，我不确定为什么带有 qsub 的 for 循环不起作用。能否请我就如何更改代码以使其正常工作获得建议？

谢谢。

Answer 1

使用 -v 要求您为变量命名：qsub -v filepath=$i script.sh，然后您可以使用 $filepath 访问 script.sh 内的文件路径。