pydicom：数据集没有属性“TransferSyntaxUID”答案

【问题标题】：pydicom : Dataset does not have attribute 'TransferSyntaxUID'pydicom：数据集没有属性“TransferSyntaxUID”
【发布时间】：2017-09-05 00:38:40
【问题描述】：

您好，我正在为使用 pydicom 读取 DICOM 文件而苦恼

这篇文章不同于 pydicom 'Dataset' object has no attribute 'TransferSyntaxUID'

这是我的代码

import dicom
dicom.read_file(file,force=True)

这会导致错误

        AttributeError                            Traceback (most recent call last)
    <ipython-input-32-a32aef2d2178> in <module>()
    ----> 1 dicom.read_file(raw_path + pat_lst[0] + '\\' + pat_dcm_lst[0],force=True)

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\filereader.pyc in read_file(fp, defer_size, stop_before_pixels, force)
        612     try:
        613         dataset = read_partial(fp, stop_when, defer_size=defer_size,
    --> 614                                force=force)
        615     finally:
        616         if not caller_owns_file:

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\filereader.pyc in read_partial(fileobj, stop_when, defer_size, force)
        520     if preamble:
        521         file_meta_dataset = _read_file_meta_info(fileobj)
    --> 522         transfer_syntax = file_meta_dataset.TransferSyntaxUID
        523         if transfer_syntax == dicom.UID.ImplicitVRLittleEndian:
        524             pass

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\dataset.pyc in __getattr__(self, name)
        254         if tag not in self:
        255             raise AttributeError("Dataset does not have attribute "
    --> 256                                  "'{0:s}'.".format(name))
        257         else:  # do have that dicom data_element
        258             return self[tag].value

    AttributeError: Dataset does not have attribute 'TransferSyntaxUID'.

我认为匿名时出了点问题。我想知道为什么会这样。

是否删除了与 DICOM 标准相关的 TransferSyntaxUID？

而且，我可以阅读MATLAB、VTK、ITK 但pydicom

所以现在我要做的是通过 SimpleITK 手动设置 TransferSyntaxUID 并通过 pydicom 再次读取。

我会告诉你什么时候有效

提前致谢

【问题讨论】：

标签： python matlab dicom itk pydicom

【解决方案1】：

pydicom 存储库有一个更新，可以容忍丢失的传输语法。作为下一个版本之前的解决方法，您可以修改 filereader.py 中的几行，如图所示 here

【讨论】：

【解决方案2】：

根据我对 DICOM 标准的理解，传输语法 UID (0002,0010) 似乎是一个强制性标签。这是一个type 1 tag，表示它是is required。

虽然这是标准所说的，但即使缺少此标记，库也可能能够读取此类文件。我猜这是因为标准还定义了default transfer syntax。

关于使用 SimpleITK 设置值，这绝对可以。此外，如果您需要验证您的文件是否符合标准，您可以使用 David Clunie 的 dicom3tools，特别是 dciodvfy 和 dcdump。

【讨论】：

HI zivy，是的，谢谢您的回答，我同意您的观点，即传输语法是强制性的，但我想知道 DICOM 标准中的匿名协议允许空传输语法，如表 E 中所述。 PS 3.15 中的 1-1。 PS.3.15 pdf
嗨 JessieB，很遗憾，匿名化超出了我的 DICOM 专业知识范围。我对遵循 DICOM 规范的匿名者持怀疑态度，因为匿名数据不打算用于患者治疗。我怀疑他们不遵循标准是很常见的（只是基于个人软件开发经验的意见）。