注释 DICOM 文件

Question

我正在寻找一个在 Python 内部或外部的应用程序，它允许我获取现有的 DICOM 文件，随后将一些标记添加到医学图像（例如彩色点），然后保存这些标记的坐标和最终图像。这是可以做的事情吗？ PyDicom 或其他程序？欢迎任何想法。

Answer 1

您永远不应编辑现有的 DICOM 实例。长话短说，DICOM 存储了一个名为Unique Instance UID 的唯一标识符。这意味着，如果您编辑该文件，添加一个后模态叠加，然后将其发送回 PACS 系统，它将被丢弃（按设计！）。

因此，通常的方法是创建另一个 DICOM 实例，在这种情况下，我建议使用简单的Grayscale Softcopy Presentation State IOD，然后简单地引用现有的 DICOM 图像。您可以拥有任意数量的灰度软拷贝表示状态实例，这比对现有 DICOM 实例进行粗略的就地编辑更加灵活。

Answer 2

让我稍微扩展一下@malat 的答案。

您可以使用 pydicom 库从头开始编写新的 DICOM 文件。在您的情况下，您将需要查看Grayscale Softcopy Presentation State CIOD，并且对于标记为“M”的每个模块表示强制，填写所有标记为“1”（需要）或“1C”（有条件需要）的属性.您还应该填写任何标记的“2”或“2C”（如果已知则为必填项）。

您可以从您正在注释的图像中复制许多 DICOM 标签。例如。 Type of Patient ID 是必需的，并且位于强制模块中，因此您可以从原始图像中复制其值。

您将生成的大部分新数据将进入Overlay Plane 模块。