在 Openlink Virtuoso 中加载和查询默认和命名的 RDF 图答案

【问题标题】：Loading and querying default and named RDF graphs in Openlink Virtuoso在 Openlink Virtuoso 中加载和查询默认和命名的 RDF 图
【发布时间】：2017-05-16 20:38:38
【问题描述】：

我是 OpenLink Virtuoso 的新手，我对加载 RDF 图和通过 Java 和 Virtuoso Jena Provider 对它们执行 SPARQL 查询有一些疑问。

我在运行 Ubuntu 16.04 桌面版的 PC 上安装了 Virtuoso 版本 06.01.3127。另外，我使用 Virtuoso Jena Provider 3 和 Virtuoso JDBC 4 Driver。

我想运行 SPARQL 查询来调用默认图和命名图，如下所示：

prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
prefix cc: <http://example.org/cc/>
SELECT ?c1 ?sx ?c2 ?m
FROM <http://test.org>
WHERE { ?c1 rdf:type cc:Test1; cc:p11 ?sx.
     ?c2 rdf:type cc:Test2; cc:p21 ?sx; cc:p22 ?m.
     FILTER EXISTS { GRAPH <http://testA.org> {?m cc:p cc:M.} }
}

因此假设存在一个默认图 (http://test.org) 和一个命名图 (http://testA.org)。

我尝试使用VirtDataset如下：

VirtModel Model1 = VirtModel.openDefaultModel("jdbc:virtuoso://localhost:1111/charset=UTF-8", <usr>, <pass>);
Model1.read(RDF1InputStream, null, "TTL");
VirtModel Model2 = VirtModel.openDatabaseModel("http://testA.org", "jdbc:virtuoso://localhost:1111/charset=UTF-8", <usr>, <pass>);
Model2.read(RDF2InputStream, null, "TTL");
VirtDataset virtDataset = new VirtDataset("jdbc:virtuoso://localhost:1111/charset=UTF-8", <usr>, <pass>);
virtDataset.setDefaultModel(Model1);
virtDataset.addNamedModel("http://testA.org", Model2);

String queryString = "prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
        prefix cc: <http://example.org/cc/>
        SELECT ?c1 ?sx ?c2 ?m
        WHERE { ?c1 rdf:type cc:Test1; cc:p11 ?sx.
         ?c2 rdf:type cc:Test2; cc:p21 ?sx; cc:p22 ?m.
         FILTER EXISTS { GRAPH <http://testA.org> {?m cc:p cc:M.} }
        }";
Query query = QueryFactory.create(queryString);
QueryExecution qe = QueryExecutionFactory.create(query, virtDataset);
ResultSet rs = qe.execSelect();
while (rs.hasNext()) {
    System.out.println(rs.next());
}
qe.close();
virtDataset.close();

但是，它最终会出现以下错误：Model1.read(RDF1InputStream, null, "TTL");

Exception in thread "main" org.apache.jena.shared.JenaException: java.sql.BatchUpdateException: SR185: Undefined procedure DB.DBA.rdf_insert_triple_c.
    at virtuoso.jena.driver.VirtGraph.stopBatchAdd(VirtGraph.java:1090)
    at virtuoso.jena.driver.VirtModel.read(VirtModel.java:273)
    at VirtuosoTest.main(VirtuosoTest.java:45)
Caused by: java.sql.BatchUpdateException: SR185: Undefined procedure DB.DBA.rdf_insert_triple_c.
    at virtuoso.jdbc4.VirtuosoPreparedStatement.throwBatchUpdateException(VirtuosoPreparedStatement.java:520)
    at virtuoso.jdbc4.VirtuosoPreparedStatement.executeBatchUpdate(VirtuosoPreparedStatement.java:156)
    at virtuoso.jdbc4.VirtuosoPreparedStatement.executeBatch(VirtuosoPreparedStatement.java:541)
    at virtuoso.jena.driver.VirtGraph.stopBatchAdd(VirtGraph.java:1083)
    ... 2 more

是否缺少程序DB.DBA.rdf_insert_triple_c？我该如何解决这个问题？

作为替代方案，我尝试使用VirtGraph，如下所示：

VirtGraph virtGraphTest = new VirtGraph("http://test.org", "jdbc:virtuoso://localhost:1111/charset=UTF-8", <usr>, <pass>);
virtGraphTest.read("file://test/test.ttl", "TTL");
virtGraphTest.close();
VirtGraph virtGraphTestA = new VirtGraph("http://testA.org", "jdbc:virtuoso://localhost:1111/charset=UTF-8", <usr>, <pass>);
virtGraphTestA.read("file://test/testA.ttl", "TTL");
virtGraphTestA.close();
VirtGraph virtGraph = new VirtGraph("jdbc:virtuoso://localhost:1111/charset=UTF-8", <usr>, <pass>);

String queryStringTest = " prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
        prefix cc: <http://example.org/cc/>
        SELECT ?c1 ?sx ?c2 ?m
        FROM <http://test.org>
        WHERE { ?c1 rdf:type cc:Test1; cc:p11 ?sx.
         ?c2 rdf:type cc:Test2; cc:p21 ?sx; cc:p22 ?m.
         FILTER EXISTS { GRAPH ?g {?m cc:p cc:M.} FILTER(?g=<http://testA.org>) }
        }";
Query queryTest = QueryFactory.create(queryStringTest);
VirtuosoQueryExecution qet = VirtuosoQueryExecutionFactory.create(queryTest, virtGraph);
ResultSet rst = qet.execSelect();
while (rst.hasNext()) {
    System.out.println(rst.next());
}
qet.close();
virtGraph.close();

这似乎工作正常。

请注意，在 SPARQL 查询的 GRAPH 声明中，我使用 GRAPH ?g 和 FILTER (?g=<http://testA.org>) 来指定命名图。

如果我改用GRAPH <http://testA.org>，则解析查询，但根据查询结果，GRAPH 声明似乎被忽略了。

在 Virtuoso 的 SPARQL 查询中调用 GRAPH 的正确方法是什么？

总的来说，我想知道在 Virtuoso 中处理 RDF 数据集和调用默认和命名 RDF 图的 SPARQL 查询的最佳实践是什么？

我已经在 Google 上搜索了这些问题，但我没有看到一个有启发性的例子。

抱歉发了这么长的帖子，提前谢谢你！

【问题讨论】：

标签： sparql rdf jena virtuoso named-graphs

【解决方案1】：

过程DB.DBA.rdf_insert_triple_c 内置在 Virtuoso 服务器中，在旧版本的 Virtuoso 6.x 中不存在（您的版本是 2013 年或更早的版本）。

您可以安装Virtuoso server 7.x 的current version（强烈推荐），或为Virtuoso 6.x 使用旧版本的Virtuoso Jena 提供程序。

【讨论】：