【发布时间】:2018-04-26 11:04:53
【问题描述】:
我正在尝试在一组 3D MRI 体积上训练 vnet 架构,并且我想尝试为每个图像添加一个具有不同回波时间的通道,从而有效地使其成为 4D。我看到 niftynet 允许输入 4D 图像,但我收到错误消息,指出 vnet 不允许包含时间维度的输入。对我来说,更改源代码或如何组合渠道的最佳位置是什么?
谢谢
【问题讨论】:
标签: niftynet
我正在尝试在一组 3D MRI 体积上训练 vnet 架构,并且我想尝试为每个图像添加一个具有不同回波时间的通道,从而有效地使其成为 4D。我看到 niftynet 允许输入 4D 图像,但我收到错误消息,指出 vnet 不允许包含时间维度的输入。对我来说,更改源代码或如何组合渠道的最佳位置是什么?
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【问题讨论】:
标签: niftynet
NiftyNet 遵循the nifti1 format,其中前三个轴用于空间维度,第四轴用于时间,第五轴用于多模态值。因此,使用多通道输入的一种方法是创建带有 [Height, Width, Depth, 1, Channels] 数组的 .nii 文件。
【讨论】: