python 的哪个统计模块支持单向方差分析和事后测试（Tukey、Scheffe 或其他）？答案

【问题标题】：What statistics module for python supports one way ANOVA with post hoc tests (Tukey, Scheffe or other)?python 的哪个统计模块支持单向方差分析和事后测试（Tukey、Scheffe 或其他）？
【发布时间】：2013-04-09 14:18:43
【问题描述】：

我已尝试查看 Python 的多个统计模块，但似乎找不到任何支持 one-way ANOVA 事后测试的模块。

【问题讨论】：

TukeyHSD 内置于 R 中。这是否符合您的要求？
statsmodels 在沙盒中有一个tukeyhsd 函数，但我没试过。
我正在寻找相同的功能，我想我会使用 RPy，一个 R 的接口，它看起来像一个魅力！
见scikit-posthocs。

标签： python statistics scipy ipython statsmodels

【解决方案1】：

单方面的方差分析可以像这样使用

from scipy import stats
f_value, p_value = stats.f_oneway(data1, data2, data3, data4, ...)

这是一种方差分析，它返回 F 值和 P 值。
如果 P 值低于您的设置，则存在显着差异。

Tukey-kramer HSD 测试可以像这样使用

from statsmodels.stats.multicomp import pairwise_tukeyhsd
print pairwise_tukeyhsd(Data, Group)

这是多重比较。输出是这样的

Multiple Comparison of Means - Tukey HSD,FWER=0.05
================================================
group1 group2 meandiff   lower    upper   reject
------------------------------------------------
  0      1    -35.2153 -114.8741 44.4434  False 
  0      2     46.697   -40.4993 133.8932 False 
  0      3    -7.5709    -87.49  72.3482  False 
  1      2    81.9123    5.0289  158.7956  True 
  1      3    27.6444   -40.8751  96.164  False 
  2      3    -54.2679 -131.4209 22.8852  False 
------------------------------------------------

请参考this网站如何设置参数。
statsmodels 的 tukeyhsd 不返回 P 值。
因此，如果您想知道 P 值，请根据这些输出值计算或使用 R。

【讨论】：

将输出保存到变量res后，可以通过应用psturng(np.abs(res.meandiffs / res.std_pairs), len(res.groupsunique), res.df_total)得到p值，其中psturng来自from statsmodels.stats.libqsturng import psturng
我使用类似于@JavierdelaRosa 建议的方法将 p 值添加到表和输出属性。应该很快添加 - 请参阅pull request。
@ami_GS 你如何让它打印结果？当我这样做时，它只会在 0x0DBEBB10 处打印“tukeyHSDResults 对象....对不起基本问题...

【解决方案2】：

我认为库 Pyvttbl 返回一个 ANOVA 表，包括事后测试（即 TukeyHSD）。事实上，Pyvttbl 的巧妙之处在于您还可以对重复测量进行 ANOVA。

查看 Anova1way 的文档here

【讨论】：

很遗憾，此库不再受支持。