如何以正确的方式向 PBS 系统提交作业列表？答案

【问题标题】：How to submit a list of jobs to PBS system in a proper way?如何以正确的方式向 PBS 系统提交作业列表？
【发布时间】：2016-08-30 10:20:47
【问题描述】：

我只能同时向 PBS 系统提交 10 个作业。如果我有独立的99个脚本，我希望有一个脚本可以一键完成所有这99个脚本。

jobs1.sh
jobs2.sh
jobs3.sh
.
.
jobs99.sh

目的是在完成之前的 10 个作业后，再提交 10 个作业。目前，我正在使用 sleep 通过估计它们需要多少时间来分隔每 10 个工作。我知道这不是一个好方法......

【问题讨论】：

【解决方案1】：

您需要查看有关依赖项的 PBS 部分。有一些很好的方法可以在之前的作业完成后排队运行作业。例如-

qsub  -W depend=afterok:Job_ID job11.sh

Job_ID 可以是 job1.sh 的 JOB_ID。

所以 job11 仅在 job1 完成后运行。您可以详细说明这个想法并设置一个循环。

【讨论】：