向 PBS/Torque 提交 SGE 作业答案

【问题标题】：Submitting an SGE job to PBS/Torque向 PBS/Torque 提交 SGE 作业
【发布时间】：2014-09-29 22:17:21
【问题描述】：

您好，我正在设置一个软件管道（一种广泛的生物信息学注释工具），它最初是为提交 SGE 作业而编写的，但我在 PBS/Torque 集群上。关于将这些脚本从 SGE 转换为 PBS 的方法有什么想法吗？或者可以向 PBS 提交 SGE 作业的可用软件？

谢谢，马库斯

【问题讨论】：

【解决方案1】：

在网上搜索发现：

使用上面链接中的表格创建一个执行替换的脚本会很简单，如果不是有些乏味的话。

【讨论】：

【解决方案2】：

以下是 Torque 和 SGE 命令的有用并排比较： https://kb.iu.edu/d/avgl.

我不知道有什么工具可以自动转换脚本，因为在某些方面这两个系统可能完全不同（例如，它们处理并行环境的方式不同，等等）。

【讨论】：