使用 knitr 将 R 脚本转换为 HTML。完整的基础知识答案

【问题标题】：R script to HTML with knitr. Complete basics使用 knitr 将 R 脚本转换为 HTML。完整的基础知识
【发布时间】：2015-02-11 01:47:23
【问题描述】：

我想知道如何将 R 脚本转换为 HTML 报告（从听起来使用 knitr 是可行的方法）。如果可能，我想不使用使用 RStudio。

假设我必须遵循 R 脚本

#Load librarys + initilisation calculations
#User shouldn't see the next 2 lines
library(foo)
set.seed(42)

#User will see the next 3 lines
print("This is some text to describe what the user is about to see")
head(mtcars)
boxplot(mtcars$mpg~mtcars$cyl)


#Not shown to user:
numbers <- runif(100)
moreNumbers <- rnorm(100)
group <- c(rep("a",100), rep("b",100))
df <- data.frame(c(numbers, moreNumbers), group)
names(df) <- c("ExampleData", "g")


#Show to user 
t.test(df$ExampleData~df$g)

我试过浏览互联网，感觉好像所有步骤都比我理解的有点太远了。

我是否需要制作另一个 R 脚本，其中包含调用上述脚本的 stitch()/knit() 函数？

谢谢，

【问题讨论】：

你不需要 Rstudio 来使用 knitr。见rmarkdown.rstudio.com

标签： r knitr

【解决方案1】：

在您的 R 脚本上调用 knitr::spin()。或者等效地，单击 RStudio 工具栏上的notebook button。

【讨论】：

实际上非常接近！如果需要，有没有办法抑制代码行的输出？
@testuser 是的，你可以像往常一样使用块选项，语法有点不同，例如#+ results='hide', eval=TRUE 请查看我在答案中包含的链接。

【解决方案2】：

关于制作另一个脚本的问题的答案是否定的。您需要做的是knit("your_script.R") 或任何名称。但首先，您必须使其符合knitr 约定。有许多示例文件 here 可以用来纠正错误。

【讨论】：

所以基本上只需要重新格式化“your_script.R”？
您只需要编辑它。查看链接，在演示下，然后是最小示例。每个代码块都有一个标题行，它告诉knitr 做什么、是否显示以及许多其他选项。修复上面的脚本只需几分钟。如果您希望将 html 作为输出，您应该使用 .Rmd 扩展名命名您的脚本，以便 knitr 自动创建 html。
更正：对于 html 输出使用script.Rhtml。见?knit。