reticulate 在 Linux 上找不到 conda env答案

【问题标题】：reticulate won't find conda env on Linuxreticulate 在 Linux 上找不到 conda env
【发布时间】：2021-01-08 18:22:05
【问题描述】：

这让我发疯：

root@1f248ca02fb8:/# which python
/miniconda/bin/python

然后

root@1f248ca02fb8:/# Rscript -e 'library(reticulate); py_config()'
Error: Python shared library not found, Python bindings not loaded.
Use reticulate::install_miniconda() if you'd like to install a Miniconda Python environment.
Execution halted

为什么reticulate 找不到miniconda？

更新

这也没有帮助：

root@1f248ca02fb8:/# Rscript -e 'library(reticulate); use_miniconda("/miniconda/bin/python", required=T); py_config()'Error in use_miniconda("/miniconda/bin/python", required = T) : 
Miniconda is not installed.
Use reticulate::install_miniconda() to install Miniconda.
Execution halted

【问题讨论】：

标签： python r reticulate

【解决方案1】：

如果你想避免这个错误，你只需要告诉reticulate使用哪个环境。

对于普通的 Python：只需将use_python("/usr/bin/python", required=T) 添加到您的代码中即可。

对于迷你康达：

use_miniconda("/miniconda/bin/python", required = T)

或另一个 python 二进制文件的路径。正常的 conda 或其他环境也是可能的。然后签入documentation

【讨论】：

@coulminer 因为我没有使用 miniconde 的经验，你也用use_python 尝试过吗？
是的，我做了@mischva11，也没有帮助。最后我放弃了，删除了 miniconda 安装并通过“install_miniconda()”再次显式安装它并且它工作。实际上这一切都发生在 Dockerfile 中，所以也许我错误地配置了 miniconda 安装。