【问题标题】:Subtracting from random values in a weighted matrix in R从 R 中的加权矩阵中的随机值中减去
【发布时间】:2011-08-12 06:00:28
【问题描述】:

提前感谢您的帮助!

这个问题与我发布的 before 相关,但我认为它值得单独发布,因为它是一个单独的挑战。

上次我询问在添加向量后从矩阵中随机选择值。在那个例子中,矩阵和向量都是二进制的。现在我想在添加加权向量后更改加权矩阵中的值。这是一些示例代码。

require(gamlss.dist)
mat1<-matrix(c(0,0,0,0,1,0, 0,10,0,0,0,5, 0,0,0,0,1,0, 0,0,3,0,0,0, 0,0,0,0,3,0, 
  0,0,2,0,0,0, 2,1,0,1,0,1, 0,0,0,0,37,0, 0,0,0,2,0,0, 0,0,0,0,0,1, 1,0,0,0,0,0, 
  0,1,1,0,0,0), byrow=T, ncol=6, nrow=12)

vec1<-c(0,0,0,1,1,1)
ones <- which(vec1 == 1L)
temp=rZIP(sum(vec1))      #rZIP is a function from gamlss.dist that randomly selects values from a zero-inflated distribution
vec1[ones]<-temp

向量中的值是从零膨胀分布中采样的(感谢this question)。当我将向量绑定到矩阵时,我想从同一列中随机选择一个非零值,然后从中减去向量值。如果向量值大于同一列中随机选择的值,我会看到更复杂的情况。在这种情况下,它只会将该值设置为零。

这里是之前问题中的一些修改过的代码,它不适用于这个问题,但可能会有所帮助。

foo <- function(mat, vec) {
    nr <- nrow(mat)
    nc <- ncol(mat)
    cols <- which(vec != 0)        #select matrix columns where the vector is not zero
    rows <- sapply(seq_along(cols),
      function(x, mat, cols) {
        ones <- which(mat[,cols[x]] != 0)
        out <- if(length(ones) != 0) {
             ones
             } else {
                sample(ones, 1)
                }
             out
             }, mat = mat, cols = cols)
    ind <- (nr*(cols-1)) + rows           #this line doesn't work b/c it is not binary
    mat[ind] <- 0                         #here is where I would like to subtract the vector value
    mat <- rbind(mat, vec)
    rownames(mat) <- NULL
    mat
}

有什么想法吗?再次感谢所有出色的帮助!

编辑:

感谢下面 bnaul 的帮助,我离答案更近了,但我们遇到了上次遇到的同样问题。示例函数在只有一个非零值的列上无法正常工作。我已经使用 Gavin Simpson 的 if else 语句解决了这个问题(这是前一个案例中的解决方案)。我调整了矩阵,使其列只有一个非零值。

 mat1<-matrix(c(0,0,0,0,1,0, 0,0,0,0,0,5, 0,0,0,0,1,0, 0,0,0,0,0,0, 0,0,0,0,3,0, 
   0,0,2,0,0,0, 2,1,0,1,0,1, 0,0,0,0,37,0, 0,0,0,2,0,0, 0,0,0,0,0,1, 1,0,0,0,0,0, 
   0,0,0,0,0,0), byrow=T, ncol=6, nrow=12)

vec1<-c(0,1,0,0,1,1)
ones <- which(vec1 == 1L)
temp=rZIP(sum(vec1))
vec1[ones]<-temp 

mat2 = rbind(mat1, vec1)     
apply(mat2, 2, function(col) {       #Returns matrix of integers indicating their column 
                                     #number in matrix-like object
    nonzero = which(head(col,-1) != 0);      #negative integer means all but last # of elements in x
    sample_ind = if(length(nonzero) == 1){
      nonzero
      } else{
        sample(nonzero, 1)
        }
        ;                             #sample nonzero elements one time
    col[sample_ind] = max(0, col[sample_ind] - tail(col,1));    #take max of either 0 or selected value minus Inv
    return(col)
    }
  )

再次感谢!

【问题讨论】:

  • 尽管您提供了示例数据,甚至您对代码的尝试和旧问题的链接,但我很惊讶没有人接受这个。也许是因为你想做什么并不完全清楚(“当我将向量绑定到矩阵时”:你在这里是什么意思?)。也许您可以阐明您的意图和/或展示您想要的结果的示例?
  • 这可能是因为示例代码存在一些问题;您没有定义 m,也没有指定 rZIP 来自哪个包(gamlss)。不过,我现在正在尝试一下。
  • 对不起!我将进行编辑以使其更清晰。

标签: r matrix sample weighted


【解决方案1】:
mat2 = rbind(mat1, vec1)    
apply(mat2, 2, function(col) {
    nonzero = which(head(col,-1) != 0);
    sample_ind = sample(nonzero, 1);
    col[sample_ind] = max(0, col[sample_ind] - tail(col,1));
    return(col)
    }
)

我做了一些简化;希望它们不会与您的想法相冲突。首先,我忽略了只对向量的非零元素进行操作的要求,因为从任何东西中减去 0 都不会改变它。其次,我绑定矩阵和向量,然后对结果按列执行操作,因为这比在两个单独的数据结构中跟踪索引然后将它们组合起来要容易一些。

【讨论】:

  • 太棒了,谢谢你……你在清理我凌乱的代码方面做得很好。
  • 对不起,我遇到了我们上次遇到的问题。如果列中只有一个值可供抽样,则抽样函数有问题。 “...(在)列中只有一个 1 的情况下...如果我们只是从长度为 1 的向量中采样,R 的 sample() 将把它当作我们想从集合 seq_len( n) 不是来自长度 1 集合 n。”加文·辛普森(Gavin Simpson)用“if else”声明来处理它。我会看看我能不能弄明白。
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