在 R 中，如何使用 combn 检索完整的矩阵？

Question

我的问题，删除特定目的，看起来像这样： 如何转换这样的组合： 先用combn(letters[1:4], 2)计算组合

     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6]
[1,] "a"  "a"  "a"  "b"  "b"  "c" 
[2,] "b"  "c"  "d"  "c"  "d"  "d" 

使用每一列获取另一个数据框：

   [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6]
[1,] 1    2    3    4   5     6

获取元素，例如：第一个元素，从上述dataframe的第一列

那么我如何将上面的数据框转换为矩阵，例如结果，例如：

   a   b   c  d
a  0   1   2  3
b  1   0   4  5
c  2   4   0  6
d  3   5   6  0

具有相同列名和行名的元素将具有零值，而其他元素对应于上述值

Answer 1

这是一种可行的方法：

inputs <- letters[1:4]
combs <- combn(inputs, 2)
N <- seq_len(ncol(combs))
nams <- unique(as.vector(combs))
out <- matrix(ncol = length(nams), nrow = length(nams))
out[lower.tri(out)] <- N
out <- t(out)
out[lower.tri(out)] <- N
out <- t(out)
diag(out) <- 0
rownames(out) <- colnames(out) <- inputs

这给出了：

> out
  a b c d
a 0 1 2 3
b 1 0 4 5
c 2 4 0 6
d 3 5 6 0

如果我必须经常这样做，我会将这些函数调用包装到一个函数中。

另一种选择是使用as.matrix.dist() 通过手动设置"dist" 对象为我们进行转换。使用之前的一些对象：

## Far easier
out2 <- N
class(out2) <- "dist"
attr(out2, "Labels") <- as.character(inputs)
attr(out2, "Size") <- length(inputs)
attr(out2, "Diag") <- attr(out2, "Upper") <- FALSE
out2 <- as.matrix(out2)

这给出了：

> out2
  a b c d
a 0 1 2 3
b 1 0 4 5
c 2 4 0 6
d 3 5 6 0

同样，如果我必须多次执行此操作，我会将其包装在一个函数中。

Answer 2

它必须是对角线上有零的镜像矩阵吗？

combo <- combn(letters[1:4], 2)
in.combo <- matrix(1:6, nrow = 1)
combo <- rbind(combo, in.combo)
out.combo <- matrix(rep(NA, 16), ncol = 4)
colnames(out.combo) <- letters[1:4]
rownames(out.combo) <- letters[1:4]

for(cols in 1:ncol(combo)) {
    vec1 <- combo[, cols]
    out.combo[vec1[1], vec1[2]] <- as.numeric(vec1[3])
}

> out.combo
   a  b  c  d
a NA  1  2  3
b NA NA  4  5
c NA NA NA  6
d NA NA NA NA