如何确保从 R 中检索数字矩阵答案

【问题标题】：How to ensure a numeric matrix is retrieved from R如何确保从 R 中检索数字矩阵
【发布时间】：2021-04-17 17:29:43
【问题描述】：

在使用default_converter 和pandas2ri.converter 本地转换器建立的本地转换上下文中，我获得了一个rpy2.robjects.vectors.BoolMatrix 对象（分配给变量res）：

<rpy2.robjects.vectors.BoolMatrix object at 0x7fa48d531040> [RTYPES.LGLSXP]
R classes: ('matrix', 'array')
[NA, NA, NA]

我需要从这个对象构建一个 pandas 数据框。但是，转换给出：

pd.DataFrame(res)
            0
0 -2147483648
1 -2147483648
2 -2147483648

如何确保将这种矩阵转换为nan 值？

【问题讨论】：

标签： python rpy2

【解决方案1】：

这可能是 rpy2 方面的转换 buglet。推荐的方法是 1）在 Github 上的 rpy2 跟踪器上打开一个问题，2）在修复之前有以下解决方法：

import math
import rpy2.robjects as ro

# Let dataf_pd be the pandas DataFrame resulting from the conversion from
# an R data.frame and "x" be the name of the column of booleans with NAs.
dataf_pd.loc[dataf_pd.x == ro.NA_Logical] = math.nan

【讨论】：