有关列表中多个图形的信息 (igraph)答案

【问题标题】：Information about multiple graphs in list (igraph)有关列表中多个图形的信息 (igraph)
【发布时间】：2021-01-13 15:29:36
【问题描述】：

晚上好，我有中等数量的图表（42），我需要有关（例如传递性分数）的信息。所有图形都是 iGraph 对象。我的目标是将函数中的信息直接写入数据框。但是，我的图表的构成发生了变化：一些节点保持不变，但其他一些节点对于每个波都是不同的。

我目前的做法是这样的：

#example graphs:
g1 <- graph.star(n=10, mode="out")
g2 <- graph.star(n=14, mode="out")
g3 <- graph.star(n=12, mode="out")
g4 <- graph.star(n=17, mode="in")

# make a list of graphs:
g_list <- (g1,g2,g3,g4)

# here is the function I wrote:
calc.transitivity <- function(g_list){
g_trans <- (transitivity(g_list))
return(g_trans)
}

# let it run:
info.trans <- lapply(g_list, calc.transitivity)

对我来说足够公平。现在，理想情况下，我可以在其中添加更多的东西（例如，centralization.betweenness）以及在节点级别计算事物的函数（例如，哪个节点在一年中具有最高程度？）。我想把它写到一个数据框中，但我不确定如何 a) 尊重每个图的节点组成的变化，b) 不知道我是否可以在其中获取有关单个节点的信息并将图作为某种“聚合单元”。

提前感谢您的帮助。如果有更优雅的方式来编写我的函数，我也很感兴趣。

【问题讨论】：

标签： r function loops igraph

【解决方案1】：

我找到了一个解决方案 - 不优雅，但它有效：

calc.density <- function(g_list){
g_dens <- (edge_density(g_list))
return(g_dens)
}

list_density <- lapply(g_sb, calc.density)
d <- as.data.frame(matrix(0, ncol = 1, nrow = 323))
d$density <- unlist(list_density)

【讨论】：