【问题标题】:GraphPad Mann Whitney scatter plot in RR中的GraphPad Mann Whitney散点图
【发布时间】:2013-09-27 11:34:42
【问题描述】:

我尝试制作一个类似于this:的前三个情节的情节

我找到了部分答案here,但是我不确定如何在散点图中添加 p 值。

有什么建议吗?

【问题讨论】:

标签: r plot scatter-plot


【解决方案1】:

您已经得到了部分答案。如果您只想知道如何设置 p 值,请使用 text。 (看图 C)。

text(x = 1.5, y = 73, 'p = 0.03')

如果您想要 p 值和下面的线条,假设您还想要线条上的那些大写字母,请使用 arrows 而不是 segments

arrows(1, 70, 2, length = 2, angle = 90, code = 3)

如果您坚持在基础 R 中解决这个问题,这是一个很好的学习练习,可以让您完全控制自己的情节。但是,如果您只是想完成它,我建议您使用 beeswarm 包(您正在制作 beeswarm 图)。

顺便说一句,这促使我调查为什么在蜂群图中出现那些向上弯曲的线。这是典型算法的结果。这条线向上弯曲,因为位置是通过增加 y 值来计算的。如果下一个 y 值非常接近以至于点会在 y 轴上重叠,则它会以与 x 位置成一定角度的方式绘制。在 Y 上靠近在一起的许多点会导致向上弯曲的线,直到您沿着 Y 走得足够远才能回到 X。较小的点应该可以缓解这种情况。此外,R 中的 beeswarm 包有几个可选算法也可以避免这种情况。

【讨论】:

  • “曲线”观察:有趣的旁注。谢谢!
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