R中的GraphPad Mann Whitney散点图

Question

我尝试制作一个类似于this:的前三个情节的情节

我找到了部分答案here，但是我不确定如何在散点图中添加 p 值。

有什么建议吗？

Answer 1

您已经得到了部分答案。如果您只想知道如何设置 p 值，请使用 text。 （看图 C）。

text(x = 1.5, y = 73, 'p = 0.03')

如果您想要 p 值和下面的线条，假设您还想要线条上的那些大写字母，请使用 arrows 而不是 segments。

arrows(1, 70, 2, length = 2, angle = 90, code = 3)

如果您坚持在基础 R 中解决这个问题，这是一个很好的学习练习，可以让您完全控制自己的情节。但是，如果您只是想完成它，我建议您使用 beeswarm 包（您正在制作 beeswarm 图）。

顺便说一句，这促使我调查为什么在蜂群图中出现那些向上弯曲的线。这是典型算法的结果。这条线向上弯曲，因为位置是通过增加 y 值来计算的。如果下一个 y 值非常接近以至于点会在 y 轴上重叠，则它会以与 x 位置成一定角度的方式绘制。在 Y 上靠近在一起的许多点会导致向上弯曲的线，直到您沿着 Y 走得足够远才能回到 X。较小的点应该可以缓解这种情况。此外，R 中的 beeswarm 包有几个可选算法也可以避免这种情况。